More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2603 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2603  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000566812  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  78.57 
 
 		 112 aa  175  2e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  65.14 
 
 		 112 aa  127  6e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  60.36 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  63.74 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  56.52 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 125 aa  117  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  61.32 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  54.72 
 
 		 128 aa  112  1.0000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0377  50S ribosomal protein L18  57.8 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1731  50S ribosomal protein L18  57.8 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00463126  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  58.56 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  54.13 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  55 
 
 		 120 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 124 aa  110  8.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 120 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  56.07 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  56.07 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2518  50S ribosomal protein L18  56.88 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  55.86 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  58.24 
 
 		 119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  57.14 
 
 		 128 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  61.05 
 
 		 121 aa  108  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  59.26 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 126 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  56.48 
 
 		 127 aa  108  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  60.42 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0301  50S ribosomal protein L18  56.88 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  53.91 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  57.27 
 
 		 121 aa  107  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 122 aa  107  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  52.5 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 		 120 aa  107  6e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  53.1 
 
 		 119 aa  107  8.000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 120 aa  106  9.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 120 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0270  50S ribosomal protein L18  55.96 
 
 		 119 aa  106  9.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0524919  normal  0.432762 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  59.38 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  52.5 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  59.38 
 
 		 122 aa  106  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2802  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 117 aa  106  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.449731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 		 120 aa  106  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  58 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  56.88 
 
 		 120 aa  105  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  50.93 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06410  50S ribosomal protein L18  59.78 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00978537  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  60.22 
 
 		 118 aa  105  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  50.91 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  58.95 
 
 		 121 aa  105  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  56.25 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  56.07 
 
 		 119 aa  105  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  54.72 
 
 		 118 aa  104  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0564  50S ribosomal protein L18  59.79 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2308  ribosomal protein L18  49.15 
 
 		 117 aa  104  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000272436  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 121 aa  103  5e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0578  50S ribosomal protein L18  60.22 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  50.88 
 
 		 134 aa  103  6e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 120 aa  103  7e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  58.89 
 
 		 116 aa  103  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  54.39 
 
 		 116 aa  103  7e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  54.05 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  54.05 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  54.05 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  54.05 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  54.05 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1265  50S ribosomal protein L18  62.07 
 
 		 116 aa  103  8e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.218127  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  54.05 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  54.05 
 
 		 120 aa  103  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 124 aa  103  9e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  54.95 
 
 		 122 aa  103  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  58.95 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1201  50S ribosomal protein L18  54.29 
 
 		 131 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0426216 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  53.7 
 
 		 123 aa  102  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  53.98 
 
 		 117 aa  102  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  52.25 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  53.1 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  53.1 
 
 		 119 aa  102  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  50.47 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  53.15 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  50.44 
 
 		 114 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  51.85 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  60.64 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  52.73 
 
 		 121 aa  102  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0607  50S ribosomal protein L18  53.21 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  50.86 
 
 		 116 aa  102  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  53.15 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 119 aa  102  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  55.14 
 
 		 117 aa  101  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  54.63 
 
 		 120 aa  102  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  54.87 
 
 		 118 aa  100  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>