More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0858 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  100 
 
 		 119 aa  243  6e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  59.65 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  58.41 
 
 		 117 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  56.91 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  60.53 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  57.14 
 
 		 116 aa  133  9e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  55.45 
 
 		 116 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  62.38 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  63.11 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 119 aa  131  3e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  54.05 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  55.75 
 
 		 122 aa  130  6e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  61.9 
 
 		 125 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  60.61 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  60.61 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  55.28 
 
 		 122 aa  130  9e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  58.77 
 
 		 118 aa  130  9e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  54.46 
 
 		 116 aa  129  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  55.36 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  60 
 
 		 126 aa  128  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 118 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  52.99 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  62.63 
 
 		 121 aa  127  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  61.95 
 
 		 122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  53.1 
 
 		 117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  60.53 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 119 aa  127  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 124 aa  127  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  58.93 
 
 		 127 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  54.46 
 
 		 114 aa  126  1.0000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  59.65 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  63.37 
 
 		 120 aa  125  1.0000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  69.23 
 
 		 112 aa  126  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  58.1 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  56.2 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  64.36 
 
 		 112 aa  125  2.0000000000000002e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  58.41 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  56.1 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  58.77 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 		 124 aa  124  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  60.61 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 118 aa  125  3e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  58.77 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  58.77 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  58.77 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  58.77 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  58.77 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  58.77 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  58.77 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  58.77 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  58.25 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  56.14 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  55.75 
 
 		 123 aa  123  9e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  57.01 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 118 aa  123  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  58.82 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  54.33 
 
 		 127 aa  122  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  51.24 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  49.59 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  50 
 
 		 124 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  61.17 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 120 aa  121  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 124 aa  121  4e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 116 aa  121  4e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0578  50S ribosomal protein L18  57.43 
 
 		 127 aa  121  4e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  52.73 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  58.59 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  49.59 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  55.75 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  55.75 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0564  50S ribosomal protein L18  62.11 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  50 
 
 		 116 aa  120  8e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 119 aa  120  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  58.25 
 
 		 134 aa  119  9.999999999999999e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  62.11 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2603  50S ribosomal protein L18  63.74 
 
 		 112 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000566812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  62.24 
 
 		 116 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2758  ribosomal protein L18  60.82 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00984012  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  58.77 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  51.28 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  53.98 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  62.11 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  56.31 
 
 		 134 aa  118  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  48.36 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  61.29 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>