More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0598 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 124 aa  238  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  83.06 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  70.49 
 
 		 136 aa  164  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  66.67 
 
 		 127 aa  156  9e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  66.67 
 
 		 134 aa  155  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  67.52 
 
 		 134 aa  155  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  61.42 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  64.96 
 
 		 136 aa  148  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  68.81 
 
 		 124 aa  147  4e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  62.3 
 
 		 126 aa  147  5e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  61.02 
 
 		 128 aa  147  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  64.1 
 
 		 137 aa  147  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  68.87 
 
 		 134 aa  146  8e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  62.4 
 
 		 127 aa  146  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  67.92 
 
 		 128 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0578  50S ribosomal protein L18  70.3 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  63.41 
 
 		 127 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  64.29 
 
 		 123 aa  145  3e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  66.06 
 
 		 123 aa  144  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  60.48 
 
 		 122 aa  143  6e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  62.1 
 
 		 122 aa  143  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1102  LSU ribosomal protein L18P  66.04 
 
 		 127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0571737 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  65.77 
 
 		 123 aa  143  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1201  50S ribosomal protein L18  66.98 
 
 		 131 aa  141  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0426216 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  64.55 
 
 		 123 aa  140  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2672  ribosomal protein L18  62.96 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  59.83 
 
 		 125 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  63.89 
 
 		 127 aa  139  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  57.6 
 
 		 125 aa  137  4.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17010  LSU ribosomal protein L18P  59.82 
 
 		 124 aa  136  7.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000838424  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  65.45 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  58.62 
 
 		 118 aa  134  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  61.4 
 
 		 119 aa  133  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2643  ribosomal protein L18  69.7 
 
 		 123 aa  133  9e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  60.53 
 
 		 120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4299  ribosomal protein L18  75 
 
 		 129 aa  130  5e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51112  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6598  ribosomal protein L18  64.96 
 
 		 132 aa  130  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  59.13 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3907  ribosomal protein L18  73 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.296534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1048  50S ribosomal protein L18  63.11 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00198535  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1060  50S ribosomal protein L18  63.11 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172408  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1031  50S ribosomal protein L18  63.11 
 
 		 134 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295773  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  65.74 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  55.93 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  65.74 
 
 		 118 aa  127  6e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  59.13 
 
 		 121 aa  126  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  62.04 
 
 		 118 aa  125  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  60.91 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  63.73 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 		 122 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 120 aa  123  9e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 119 aa  123  9e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  56.14 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  64.65 
 
 		 121 aa  121  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  58.26 
 
 		 122 aa  120  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23640  LSU ribosomal protein L18P  62.89 
 
 		 128 aa  120  7e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429981  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  48.39 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 122 aa  118  1.9999999999999998e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  63 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  59.41 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0267  ribosomal protein L18  61.62 
 
 		 123 aa  117  7e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  55.75 
 
 		 114 aa  116  7.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  59.26 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  59.26 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  59.26 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  59.26 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  59.26 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  51.75 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  59.26 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  59.26 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  59.26 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  56.52 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  58.59 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  52.54 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  58.59 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  60.19 
 
 		 118 aa  114  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  49.18 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  56.31 
 
 		 119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0438  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>