More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6033 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 124 aa  237  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  83.06 
 
 		 124 aa  195  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  68.55 
 
 		 134 aa  171  3.9999999999999995e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  71.79 
 
 		 134 aa  168  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  73.68 
 
 		 127 aa  166  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  70.09 
 
 		 127 aa  164  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  65.35 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  69.37 
 
 		 123 aa  158  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29580  LSU ribosomal protein L18P  70.27 
 
 		 123 aa  158  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.100392  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  68 
 
 		 127 aa  159  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  68.03 
 
 		 136 aa  158  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  67.21 
 
 		 136 aa  157  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2672  ribosomal protein L18  69.44 
 
 		 127 aa  157  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  70.37 
 
 		 127 aa  157  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  66.39 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  72.64 
 
 		 134 aa  154  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  66.96 
 
 		 128 aa  154  3e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  69.09 
 
 		 123 aa  151  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  70.27 
 
 		 124 aa  151  2.9999999999999998e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17010  LSU ribosomal protein L18P  64.29 
 
 		 124 aa  150  4e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000838424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  64.8 
 
 		 125 aa  149  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  64.75 
 
 		 126 aa  148  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  63.71 
 
 		 122 aa  147  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  63.87 
 
 		 122 aa  147  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1201  50S ribosomal protein L18  66.04 
 
 		 131 aa  146  9e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0426216 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1102  LSU ribosomal protein L18P  67.92 
 
 		 127 aa  145  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0571737 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  66.98 
 
 		 128 aa  145  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2643  ribosomal protein L18  71.29 
 
 		 123 aa  142  1e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  60.68 
 
 		 125 aa  142  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1060  50S ribosomal protein L18  69.9 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00000172408  normal  0.393686 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1031  50S ribosomal protein L18  69.9 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000295773  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1048  50S ribosomal protein L18  69.9 
 
 		 134 aa  142  2e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00198535  normal  0.123064 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 119 aa  140  5e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  64.04 
 
 		 120 aa  139  9e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  61.61 
 
 		 123 aa  139  9.999999999999999e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0578  50S ribosomal protein L18  65.35 
 
 		 127 aa  135  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6598  ribosomal protein L18  69.23 
 
 		 132 aa  135  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  60.34 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  60.34 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  63.64 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  60.34 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  61.74 
 
 		 122 aa  130  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23640  LSU ribosomal protein L18P  68.04 
 
 		 128 aa  130  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.429981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  56.2 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  68 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  59.29 
 
 		 124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  58.12 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  64.81 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  53.23 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  50.81 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  64.71 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  66.67 
 
 		 121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  64.81 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  60.19 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  52.68 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  55.65 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  54.03 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  51.61 
 
 		 122 aa  123  8.000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  62.75 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  56.2 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  52.85 
 
 		 121 aa  121  3e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  59.26 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  61.21 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  62.16 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  58.12 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 116 aa  120  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  55.65 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4299  ribosomal protein L18  73 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.51112  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  60.5 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  57.98 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  56.52 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  61.34 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  56.52 
 
 		 121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  56.35 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  57.84 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  57.27 
 
 		 117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>