More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2317 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  100 
 
 		 121 aa  244  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  64.75 
 
 		 122 aa  153  9e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  63.11 
 
 		 122 aa  151  2.9999999999999998e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  61.98 
 
 		 121 aa  146  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  62.3 
 
 		 124 aa  144  6e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  61.16 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  59.5 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  59.5 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  60.33 
 
 		 121 aa  139  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 		 122 aa  135  1e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  59.5 
 
 		 118 aa  136  1e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 121 aa  134  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  56.2 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  58.68 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 118 aa  130  6e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 122 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 119 aa  128  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  57.38 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  52.89 
 
 		 121 aa  126  8.000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  52.46 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  58.2 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  58.2 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  60.38 
 
 		 114 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  53.72 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  54.55 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  59.48 
 
 		 125 aa  124  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  54.4 
 
 		 124 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  57.38 
 
 		 122 aa  124  4.0000000000000003e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 		 116 aa  123  1e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  62.3 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  62.3 
 
 		 122 aa  122  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  52.89 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  52.89 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  53.28 
 
 		 122 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  59.81 
 
 		 128 aa  120  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 		 122 aa  120  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  59.63 
 
 		 120 aa  120  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  55.65 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0302  50S ribosomal protein L18  59.02 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000021695  normal  0.152998 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0438  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560325  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  51.28 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  58.72 
 
 		 120 aa  118  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  56.56 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  55.86 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  56.73 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  56.76 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  52.07 
 
 		 121 aa  117  6e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  53.72 
 
 		 117 aa  117  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  52.07 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 119 aa  116  9e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  52.07 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 115 aa  116  9.999999999999999e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  50.82 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 124 aa  115  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  52.54 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  61.62 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  61 
 
 		 121 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 136 aa  114  3e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 137 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  49.59 
 
 		 119 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  50.45 
 
 		 128 aa  113  7.999999999999999e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  50.43 
 
 		 123 aa  113  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  45.69 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  58.59 
 
 		 123 aa  112  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  48.76 
 
 		 119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  52.99 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1201  50S ribosomal protein L18  51.4 
 
 		 131 aa  112  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0426216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  60.61 
 
 		 113 aa  111  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  59.26 
 
 		 112 aa  111  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  49.18 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  56.07 
 
 		 127 aa  110  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0578  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 127 aa  110  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  50.85 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  49.57 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  58.95 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 120 aa  109  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  51.22 
 
 		 118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>