More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1242 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 
124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  59.68 
 
 
120 aa  151  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  60.48 
 
 
122 aa  148  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  58.87 
 
 
120 aa  148  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  58.06 
 
 
120 aa  147  6e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  58.06 
 
 
120 aa  146  8e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  56.45 
 
 
120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  56.45 
 
 
120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  56.45 
 
 
120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  56.45 
 
 
120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  56.45 
 
 
120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  58.06 
 
 
119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  56.45 
 
 
120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  56.45 
 
 
120 aa  144  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  59.68 
 
 
122 aa  144  5e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  56.45 
 
 
120 aa  143  9e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  55.65 
 
 
120 aa  142  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  57.26 
 
 
121 aa  139  9e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  57.94 
 
 
122 aa  139  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  58.47 
 
 
125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  57.26 
 
 
120 aa  137  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  62.73 
 
 
120 aa  137  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  61.02 
 
 
124 aa  136  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  62.28 
 
 
120 aa  135  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  60.71 
 
 
120 aa  136  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  56.69 
 
 
121 aa  134  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 
122 aa  134  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  59.82 
 
 
120 aa  133  9e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  57.26 
 
 
122 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  52.42 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  62.39 
 
 
119 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  57.39 
 
 
118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 
122 aa  130  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  58.72 
 
 
114 aa  130  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  53.97 
 
 
122 aa  130  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 
121 aa  130  6.999999999999999e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  51.61 
 
 
122 aa  130  6.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  52.42 
 
 
119 aa  130  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  52.42 
 
 
119 aa  130  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 
119 aa  130  7.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  58.06 
 
 
122 aa  129  9e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  59.65 
 
 
118 aa  129  9e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  59.29 
 
 
124 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  58.04 
 
 
120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  55.65 
 
 
119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  55.65 
 
 
119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  52.42 
 
 
122 aa  128  3e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  52.94 
 
 
117 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 
122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  54.92 
 
 
119 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  57.02 
 
 
127 aa  126  9.000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  56.52 
 
 
120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  54.03 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  54.13 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  57.27 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  60.48 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  60.48 
 
 
122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  52.42 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  53.23 
 
 
118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  55.83 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  55.65 
 
 
120 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  59.46 
 
 
134 aa  124  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  54.4 
 
 
121 aa  125  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  52.59 
 
 
128 aa  125  3e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  56.76 
 
 
134 aa  124  4.0000000000000003e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  56.52 
 
 
120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  56.76 
 
 
128 aa  124  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  53.64 
 
 
122 aa  124  5e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  60.4 
 
 
120 aa  124  6e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  57.66 
 
 
123 aa  123  8.000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  53.66 
 
 
137 aa  123  8.000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  53.64 
 
 
122 aa  123  1e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0302  50S ribosomal protein L18  61.39 
 
 
122 aa  123  1e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000021695  normal  0.152998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  52.85 
 
 
136 aa  123  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  57.41 
 
 
121 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
120 aa  122  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  58.26 
 
 
134 aa  122  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  50.81 
 
 
118 aa  122  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  50 
 
 
119 aa  122  2e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 
120 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1102  LSU ribosomal protein L18P  56.36 
 
 
127 aa  122  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0571737 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  55.28 
 
 
136 aa  122  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  53.1 
 
 
120 aa  121  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  55.96 
 
 
120 aa  121  3e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 
122 aa  121  3e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 
120 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  49.18 
 
 
115 aa  121  4e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  60.82 
 
 
118 aa  120  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 
120 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 
122 aa  120  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  59.79 
 
 
120 aa  120  5e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 
120 aa  120  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 
122 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 
122 aa  120  7e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  53.23 
 
 
118 aa  120  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  54.81 
 
 
123 aa  120  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  58.76 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  52.89 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>