More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0724 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  100 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  59.66 
 
 		 125 aa  142  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 124 aa  140  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  55.08 
 
 		 120 aa  140  7e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  59.83 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  60.17 
 
 		 122 aa  138  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  54.84 
 
 		 122 aa  137  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 118 aa  136  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 		 121 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  54.84 
 
 		 121 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 119 aa  134  4e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  55.93 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  57.52 
 
 		 114 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 121 aa  132  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 119 aa  132  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 122 aa  131  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  52.54 
 
 		 122 aa  131  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  51.61 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  53.28 
 
 		 128 aa  131  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 120 aa  130  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 120 aa  130  3.9999999999999996e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 		 118 aa  130  5e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  52.42 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  57.39 
 
 		 120 aa  130  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  58.41 
 
 		 120 aa  130  6e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  53.23 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  56.14 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  55.93 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  53.28 
 
 		 121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 118 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0210  LSU ribosomal protein L18P  57.28 
 
 		 121 aa  128  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0545165  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  55.26 
 
 		 122 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  53.23 
 
 		 122 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 122 aa  126  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  58.1 
 
 		 122 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  55.08 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 137 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  56.25 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  50.81 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  56.25 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  57.27 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  52.89 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  57.41 
 
 		 134 aa  124  3e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  58.82 
 
 		 121 aa  124  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  52.42 
 
 		 117 aa  124  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  59.41 
 
 		 121 aa  123  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 127 aa  123  8.000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  52.5 
 
 		 126 aa  123  9e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 117 aa  122  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0949  50S ribosomal protein L18  51.61 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  55.93 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  57.28 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  54.55 
 
 		 116 aa  122  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 136 aa  121  3e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  52.89 
 
 		 134 aa  121  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 118 aa  121  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  59.41 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  54.63 
 
 		 128 aa  120  4e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  59.41 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  53.57 
 
 		 120 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 136 aa  120  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  50 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  48.39 
 
 		 124 aa  120  8e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 125 aa  120  8e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1362  ribosomal protein L18  51.61 
 
 		 122 aa  119  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  55.45 
 
 		 123 aa  120  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0302  50S ribosomal protein L18  56.44 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000021695  normal  0.152998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10734  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00420212  normal  0.645623 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  53.39 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  51.24 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  54.87 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  53.39 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  52.54 
 
 		 118 aa  117  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2758  ribosomal protein L18  59.41 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00984012  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  46.77 
 
 		 122 aa  117  7e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  50 
 
 		 116 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 112 aa  116  9e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  47.58 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>