More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_1852 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  100 
 
 
118 aa  230  5e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  55.65 
 
 
122 aa  132  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  51.61 
 
 
124 aa  131  3e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  54.05 
 
 
119 aa  131  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  55.65 
 
 
124 aa  131  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  62.75 
 
 
122 aa  127  4.0000000000000003e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 
114 aa  127  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  53.57 
 
 
121 aa  125  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 
120 aa  125  3e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  51.79 
 
 
120 aa  124  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  51.79 
 
 
120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 
121 aa  123  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  55.46 
 
 
122 aa  123  8.000000000000001e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  52.78 
 
 
118 aa  123  9e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  57.14 
 
 
117 aa  122  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 
121 aa  122  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 
120 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 
119 aa  122  1e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 
119 aa  122  1e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  56.64 
 
 
122 aa  122  2e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  51.79 
 
 
120 aa  122  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 
120 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  55.36 
 
 
122 aa  122  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 
116 aa  122  2e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  50.81 
 
 
124 aa  122  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  57.27 
 
 
120 aa  122  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  55.65 
 
 
121 aa  122  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 
120 aa  121  3e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  51.79 
 
 
120 aa  121  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  55.36 
 
 
122 aa  121  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 
120 aa  120  5e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  53.7 
 
 
116 aa  120  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
120 aa  120  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  53.98 
 
 
125 aa  120  8e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  50.85 
 
 
120 aa  120  9e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  52.94 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  50.93 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  51.85 
 
 
118 aa  119  9.999999999999999e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  60.61 
 
 
113 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  50.85 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  51.38 
 
 
116 aa  118  1.9999999999999998e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  54.55 
 
 
117 aa  119  1.9999999999999998e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  52.63 
 
 
121 aa  118  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  50.93 
 
 
118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1402  ribosomal protein L18  49.17 
 
 
121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  52.29 
 
 
119 aa  117  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  53.15 
 
 
117 aa  117  7.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  46.28 
 
 
121 aa  116  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 
120 aa  116  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  52.25 
 
 
121 aa  116  9e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  52.21 
 
 
116 aa  115  1.9999999999999998e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  46.79 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  46.79 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 
120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  52.43 
 
 
128 aa  114  5e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  48.28 
 
 
122 aa  114  5e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  49.54 
 
 
119 aa  114  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  53.15 
 
 
119 aa  114  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  49.15 
 
 
120 aa  114  6e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  50.91 
 
 
120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  48.7 
 
 
118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  50 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  50.91 
 
 
127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  50 
 
 
128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  49.53 
 
 
112 aa  111  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  54.05 
 
 
119 aa  111  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  49.54 
 
 
116 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  53.47 
 
 
123 aa  110  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  47.46 
 
 
122 aa  110  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  49.55 
 
 
120 aa  110  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  50.45 
 
 
123 aa  110  9e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  51.33 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  52.78 
 
 
115 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  49.09 
 
 
126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1145  ribosomal protein L18  51.52 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000549459  normal  0.0107289 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3127  ribosomal protein L18  46.36 
 
 
125 aa  109  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  45.69 
 
 
122 aa  109  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  48.21 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3989  ribosomal protein L18  50 
 
 
123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  48.65 
 
 
118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  51.3 
 
 
114 aa  108  3e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  46.85 
 
 
117 aa  108  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0505  50S ribosomal protein L18  55.91 
 
 
119 aa  107  4.0000000000000004e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  46.3 
 
 
117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  50.98 
 
 
122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  47.75 
 
 
120 aa  107  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>