More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0783 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 120 aa  239  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  58.26 
 
 		 116 aa  130  3.9999999999999996e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  54.78 
 
 		 117 aa  129  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3989  ribosomal protein L18  52.54 
 
 		 123 aa  123  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 120 aa  120  9e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  52.25 
 
 		 121 aa  120  9e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 118 aa  118  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 120 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  50 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  51.3 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  52.21 
 
 		 114 aa  117  7.999999999999999e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  48.72 
 
 		 119 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  48.72 
 
 		 119 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 		 114 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  48.25 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  49.15 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  48.25 
 
 		 119 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  50.86 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  50.88 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  113  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  47.83 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  52.14 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  50.91 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  47.86 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  50.91 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  48.67 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  57 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  57 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  47.37 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  48.31 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  48.33 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1145  ribosomal protein L18  55 
 
 		 122 aa  109  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000549459  normal  0.0107289 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  46.67 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  48.33 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  49.57 
 
 		 116 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2241  50S ribosomal protein L18  51.49 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272684  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  47.79 
 
 		 116 aa  108  4.0000000000000004e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  47.46 
 
 		 124 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 117 aa  107  4.0000000000000004e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  47.15 
 
 		 120 aa  107  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  46.22 
 
 		 121 aa  107  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  47.01 
 
 		 121 aa  107  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 118 aa  106  8.000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  49.14 
 
 		 118 aa  106  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0301  50S ribosomal protein L18  50.91 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1356  ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 117 aa  105  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  46.28 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  54.37 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16290  Plastid ribosomal protein L18 large ribosomal subunit  45.08 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0898056 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  49.12 
 
 		 116 aa  105  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3889  50S ribosomal protein L18P  47.5 
 
 		 127 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  47.97 
 
 		 121 aa  104  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  49.11 
 
 		 125 aa  105  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  45 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2758  ribosomal protein L18  50 
 
 		 117 aa  103  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00984012  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  48.65 
 
 		 118 aa  103  7e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1558  ribosomal protein L18  47.41 
 
 		 121 aa  103  8e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000783356  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 122 aa  103  8e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  47.79 
 
 		 119 aa  103  8e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  46.9 
 
 		 115 aa  102  1e-21  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0210  LSU ribosomal protein L18P  51.49 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0545165  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  47.5 
 
 		 124 aa  103  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0505  50S ribosomal protein L18  51.06 
 
 		 119 aa  102  2e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20710  LSU ribosomal protein L18P  50 
 
 		 124 aa  102  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  51.96 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  45.95 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1362  ribosomal protein L18  43.65 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  45.38 
 
 		 120 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  47.27 
 
 		 122 aa  102  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  46.34 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  48.15 
 
 		 128 aa  102  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2672  ribosomal protein L18  45.53 
 
 		 127 aa  101  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0075  50S ribosomal protein L18  48.62 
 
 		 118 aa  101  4e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.820764  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  48 
 
 		 117 aa  101  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0607  50S ribosomal protein L18  46.61 
 
 		 119 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  47.27 
 
 		 120 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  46.36 
 
 		 137 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  46.36 
 
 		 136 aa  100  5e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  45.95 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  45.05 
 
 		 120 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  48.15 
 
 		 123 aa  100  6e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  48.6 
 
 		 134 aa  100  8e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  48.48 
 
 		 123 aa  100  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  46.85 
 
 		 117 aa  100  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  45.05 
 
 		 120 aa  100  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  46.36 
 
 		 122 aa  100  9e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>