More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2241 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2241  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 120 aa  241  3e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.272684  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  70.83 
 
 		 119 aa  176  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  71.67 
 
 		 119 aa  171  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0095  50S ribosomal protein L18  70.83 
 
 		 119 aa  150  5e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0507743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 116 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2758  ribosomal protein L18  62.5 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00984012  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  55 
 
 		 115 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  57.26 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  54.62 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  53.78 
 
 		 118 aa  128  3e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 122 aa  127  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  54.1 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  52.59 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 119 aa  123  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  52.5 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 120 aa  122  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 		 124 aa  121  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  52.5 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  52.89 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  52.03 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 120 aa  120  8e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  51.22 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  51.22 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  51.22 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  51.22 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  51.22 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  51.22 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  51.22 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  54.78 
 
 		 114 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  52.5 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  51.22 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  50.82 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  52.07 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  49.17 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  51.22 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  51.64 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 116 aa  117  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 118 aa  116  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  49.18 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 114 aa  115  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  52.07 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  52.07 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  48.33 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  49.58 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 112 aa  114  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  52.89 
 
 		 122 aa  114  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  54.62 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 118 aa  113  7.999999999999999e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0949  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00265725  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  52.68 
 
 		 118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  50 
 
 		 119 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  48.78 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 		 122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  52.46 
 
 		 118 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  47.5 
 
 		 116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  47.62 
 
 		 121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  46.67 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 123 aa  111  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  46.61 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  110  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  55.45 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 		 117 aa  110  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  50.42 
 
 		 118 aa  110  5e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  52.5 
 
 		 136 aa  110  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1362  ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000126728  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  51.26 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  50.41 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 122 aa  110  8.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  45.83 
 
 		 122 aa  110  8.000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  55.45 
 
 		 112 aa  109  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  51.67 
 
 		 119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 124 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_002620  TC0800  50S ribosomal protein L18  45.69 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.00718139  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3989  ribosomal protein L18  47.9 
 
 		 123 aa  109  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  48.28 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  54.29 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  47.06 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  52.21 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  47.15 
 
 		 123 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  56.57 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  47.06 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  56.57 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  47.5 
 
 		 120 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  49.6 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  48.76 
 
 		 128 aa  108  3e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  48.74 
 
 		 119 aa  108  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>