More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2162 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  100 
 
 		 122 aa  245  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  82.79 
 
 		 122 aa  209  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  78.69 
 
 		 122 aa  202  1e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1145  ribosomal protein L18  59.84 
 
 		 122 aa  139  1.9999999999999998e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000549459  normal  0.0107289 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 120 aa  137  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  137  7e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  56.64 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  53.66 
 
 		 122 aa  134  6.0000000000000005e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  52.03 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  52.03 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  52.03 
 
 		 122 aa  130  6e-30  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  59.09 
 
 		 118 aa  130  6.999999999999999e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  62.75 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  52.85 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  56.9 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  58.42 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  53.72 
 
 		 118 aa  126  8.000000000000001e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 118 aa  127  8.000000000000001e-29  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  54.31 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  58.18 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  48.78 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  49.59 
 
 		 122 aa  124  6e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  50.82 
 
 		 122 aa  123  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  48.62 
 
 		 124 aa  123  9e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  52.5 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  52.46 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  50.43 
 
 		 125 aa  122  2e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1402  ribosomal protein L18  56.76 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  48.78 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  50.91 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  51.67 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  56 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  53.57 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0704  ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 127 aa  119  9.999999999999999e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.815408  normal  0.233202 
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  48.36 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  48.36 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  47.54 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  53.54 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  53.54 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  51.82 
 
 		 119 aa  118  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17251  50S ribosomal protein L18  48.65 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0643  ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.258445  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 117 aa  117  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  50.82 
 
 		 122 aa  117  7e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 119 aa  117  7e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 120 aa  117  7e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  50.82 
 
 		 121 aa  117  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3401  ribosomal protein L18  52.14 
 
 		 134 aa  116  7.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 119 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 119 aa  117  7.999999999999999e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 		 123 aa  116  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  53.7 
 
 		 134 aa  116  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  51.79 
 
 		 120 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  50.91 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16290  Plastid ribosomal protein L18 large ribosomal subunit  48.76 
 
 		 123 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0898056 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  49.11 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  51.79 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  50.46 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  45.08 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  48.33 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1139  ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  114  3e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  50.44 
 
 		 127 aa  114  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  51.79 
 
 		 120 aa  114  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  52.54 
 
 		 124 aa  115  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 121 aa  114  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  51.28 
 
 		 124 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  47.54 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  47.54 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  48.28 
 
 		 115 aa  114  6e-25  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  49.14 
 
 		 116 aa  114  6e-25  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  49.17 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  58.95 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0438  50S ribosomal protein L18  53.45 
 
 		 122 aa  112  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.560325  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  49.09 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  46.72 
 
 		 120 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  49.55 
 
 		 123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  48.7 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  47.41 
 
 		 119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  47.5 
 
 		 116 aa  111  3e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  46.28 
 
 		 136 aa  111  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  51.89 
 
 		 114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>