More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1922 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 114 aa  227  4e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  63.48 
 
 		 117 aa  145  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  61.02 
 
 		 118 aa  139  9.999999999999999e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  59.65 
 
 		 116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  62.16 
 
 		 117 aa  134  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  59.32 
 
 		 118 aa  132  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  57.52 
 
 		 117 aa  133  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  60.71 
 
 		 118 aa  131  3e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  59.29 
 
 		 119 aa  130  3.9999999999999996e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  59.5 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2385  50S ribosomal protein L18  64.86 
 
 		 115 aa  127  4.0000000000000003e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00226335  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  58.04 
 
 		 116 aa  127  6e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  57.39 
 
 		 119 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  57.39 
 
 		 119 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  54.46 
 
 		 119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  56.64 
 
 		 116 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  55.17 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 119 aa  124  3e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 117 aa  124  6e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  55.36 
 
 		 115 aa  123  7e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  53.1 
 
 		 117 aa  123  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  53.1 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04140  LSU ribosomal protein L18P  59.62 
 
 		 134 aa  120  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  60.61 
 
 		 117 aa  119  9.999999999999999e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  53.1 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  53.1 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0676  50S ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.864338  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  52.59 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  55.36 
 
 		 125 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  57.27 
 
 		 114 aa  118  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  58.93 
 
 		 121 aa  118  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  52.46 
 
 		 122 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0783  50S ribosomal protein L18  52.21 
 
 		 120 aa  117  7.999999999999999e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0707511  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 		 119 aa  116  7.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  49.15 
 
 		 120 aa  116  9e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1558  ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 121 aa  116  9e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000783356  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  51.64 
 
 		 122 aa  116  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  49.15 
 
 		 120 aa  115  1.9999999999999998e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  49.14 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  52.68 
 
 		 116 aa  115  3e-25  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  52.54 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  53.7 
 
 		 121 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  58.65 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2280  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 119 aa  114  5e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000151304  hitchhiker  0.00323172 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 		 120 aa  114  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  58.95 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  56.6 
 
 		 121 aa  114  6e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  56.6 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  52.99 
 
 		 122 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  56.6 
 
 		 121 aa  113  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  59.79 
 
 		 116 aa  113  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  113  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 122 aa  113  8.999999999999998e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  55.34 
 
 		 121 aa  113  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  53.04 
 
 		 136 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  54.46 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  50.85 
 
 		 120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  47.46 
 
 		 124 aa  112  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  58 
 
 		 121 aa  112  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  50.91 
 
 		 112 aa  112  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2758  ribosomal protein L18  57.73 
 
 		 117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00984012  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  52.21 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  59.14 
 
 		 118 aa  111  3e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 122 aa  111  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 119 aa  111  3e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  110  4.0000000000000004e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 112 aa  111  4.0000000000000004e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2162  ribosomal protein L18  51.89 
 
 		 122 aa  111  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0201582  normal  0.950902 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3690  ribosomal protein L18  55.77 
 
 		 134 aa  110  4.0000000000000004e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000255511  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2982  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 		 120 aa  110  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>