More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0337 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  100 
 
 
120 aa  228  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  85.83 
 
 
120 aa  197  3e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  96.67 
 
 
120 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  89.69 
 
 
120 aa  174  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  89.69 
 
 
120 aa  174  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  69.17 
 
 
120 aa  166  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2202  50S ribosomal protein L18  84.17 
 
 
120 aa  165  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0988305  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  70.83 
 
 
120 aa  164  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  67.5 
 
 
120 aa  161  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  74.34 
 
 
119 aa  161  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  70 
 
 
120 aa  157  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  65 
 
 
120 aa  156  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  66.67 
 
 
120 aa  155  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  64.17 
 
 
120 aa  152  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  72.07 
 
 
120 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  59.13 
 
 
120 aa  149  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  65.83 
 
 
120 aa  149  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  70.27 
 
 
120 aa  147  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  71.17 
 
 
120 aa  147  5e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  69.37 
 
 
120 aa  147  7e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  71.17 
 
 
120 aa  146  8e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2982  50S ribosomal protein L18  76.29 
 
 
120 aa  146  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1972  50S ribosomal protein L18  73.27 
 
 
120 aa  143  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000177032  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  68.47 
 
 
120 aa  143  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0564  50S ribosomal protein L18  73.96 
 
 
120 aa  142  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1217  50S ribosomal protein L18  73.27 
 
 
120 aa  141  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  71.58 
 
 
120 aa  140  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1180  50S ribosomal protein L18  72.28 
 
 
120 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  68.33 
 
 
118 aa  137  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1930  ribosomal protein L18  75.68 
 
 
120 aa  135  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  52.85 
 
 
122 aa  134  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  63.33 
 
 
118 aa  134  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2802  50S ribosomal protein L18  68.14 
 
 
117 aa  133  8e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.449731 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  63.06 
 
 
120 aa  132  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0301  50S ribosomal protein L18  60.68 
 
 
119 aa  130  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  64.86 
 
 
118 aa  130  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  54.17 
 
 
125 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  55.45 
 
 
121 aa  129  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2518  50S ribosomal protein L18  59.83 
 
 
119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1731  50S ribosomal protein L18  59.83 
 
 
119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00463126  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  59.82 
 
 
121 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0377  50S ribosomal protein L18  59.83 
 
 
119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492357  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  55.86 
 
 
122 aa  128  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 
120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  56.76 
 
 
122 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 
124 aa  126  8.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  60.18 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  56.2 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3322  50S ribosomal protein L18  56.41 
 
 
117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000880137  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0775  50S ribosomal protein L18  61.74 
 
 
119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.292736  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  54.87 
 
 
117 aa  125  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  54.7 
 
 
124 aa  125  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2308  ribosomal protein L18  54.7 
 
 
117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000272436  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 
120 aa  124  4.0000000000000003e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0270  50S ribosomal protein L18  61.4 
 
 
119 aa  124  5e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0524919  normal  0.432762 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  54.95 
 
 
122 aa  124  5e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0513  50S ribosomal protein L18  60.91 
 
 
117 aa  124  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00333829  unclonable  0.0000000000149151 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 
122 aa  124  6e-28  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0343  50S ribosomal protein L18  60.91 
 
 
117 aa  124  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0251755  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 
120 aa  122  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 
118 aa  122  1e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 
122 aa  122  1e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  62.16 
 
 
126 aa  122  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  56.78 
 
 
118 aa  122  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  58.12 
 
 
118 aa  123  1e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  60.36 
 
 
120 aa  123  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  56.25 
 
 
122 aa  122  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 
120 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  57.66 
 
 
120 aa  122  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0607  50S ribosomal protein L18  56.41 
 
 
119 aa  122  2e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 
120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  61.7 
 
 
113 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 
120 aa  121  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  61.05 
 
 
122 aa  121  3e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 
120 aa  121  3e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 
120 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 
120 aa  121  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 
120 aa  121  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  53.57 
 
 
120 aa  121  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  53.33 
 
 
117 aa  121  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  61.05 
 
 
122 aa  121  3e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 
120 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  55.56 
 
 
122 aa  121  3e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  61.05 
 
 
122 aa  121  3e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 
120 aa  121  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  59.46 
 
 
120 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  63.16 
 
 
121 aa  120  5e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 
137 aa  120  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 
122 aa  120  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  54.7 
 
 
118 aa  120  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  60.36 
 
 
112 aa  120  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23181  50S ribosomal protein L18  63.54 
 
 
122 aa  120  8e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  54.55 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  56.2 
 
 
122 aa  119  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  60 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  61.05 
 
 
121 aa  119  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  58.12 
 
 
112 aa  119  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0302  50S ribosomal protein L18  57.89 
 
 
122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000021695  normal  0.152998 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>