More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2891 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  100 
 
 
112 aa  224  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2603  50S ribosomal protein L18  78.57 
 
 
112 aa  175  2e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000566812  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  68.42 
 
 
112 aa  140  8e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  63.64 
 
 
121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  62.07 
 
 
120 aa  128  3e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  69.23 
 
 
119 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  59.81 
 
 
119 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  59.81 
 
 
119 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  58.77 
 
 
122 aa  122  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  57.5 
 
 
120 aa  120  7e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  61.11 
 
 
120 aa  120  7e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  58.82 
 
 
118 aa  120  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 
120 aa  120  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0270  50S ribosomal protein L18  58.62 
 
 
119 aa  119  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0524919  normal  0.432762 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  59.09 
 
 
120 aa  119  9.999999999999999e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  59.17 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  61.47 
 
 
120 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  61.11 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 
120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 
120 aa  118  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 
120 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 
120 aa  118  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  56.25 
 
 
115 aa  118  3e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 
120 aa  118  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 
120 aa  118  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 
120 aa  118  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 
120 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 
120 aa  118  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 
120 aa  118  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  59.32 
 
 
125 aa  118  3.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  56.48 
 
 
120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  61.82 
 
 
121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  60.19 
 
 
120 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  58.56 
 
 
120 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  56.76 
 
 
118 aa  117  7e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  57.14 
 
 
124 aa  116  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  58.72 
 
 
124 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  59.26 
 
 
120 aa  115  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  56.41 
 
 
122 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2802  50S ribosomal protein L18  58.97 
 
 
117 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.449731 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  60.36 
 
 
117 aa  115  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  57.52 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  59.43 
 
 
118 aa  114  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  57.8 
 
 
122 aa  114  3e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  57.76 
 
 
120 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  50.42 
 
 
124 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0564  50S ribosomal protein L18  62.89 
 
 
120 aa  114  3e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  59.43 
 
 
118 aa  115  3e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  61.54 
 
 
128 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  60 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  60 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  55.26 
 
 
123 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  57.01 
 
 
119 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  57.55 
 
 
128 aa  114  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  60.36 
 
 
122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  54.62 
 
 
119 aa  114  6.9999999999999995e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 
117 aa  114  6.9999999999999995e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  59.26 
 
 
126 aa  113  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  54.95 
 
 
117 aa  113  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  65.26 
 
 
121 aa  113  8.999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  60.38 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  53.64 
 
 
119 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  59.63 
 
 
120 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  60.38 
 
 
118 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  50.91 
 
 
114 aa  112  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  56.78 
 
 
120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  56.64 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  59.81 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  57.27 
 
 
121 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0241  ribosomal protein L18  62.11 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.371166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  54.95 
 
 
116 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  58.18 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 
119 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 
121 aa  111  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  59.26 
 
 
121 aa  111  3e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  53.04 
 
 
127 aa  111  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  49.53 
 
 
118 aa  111  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 
114 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0301  50S ribosomal protein L18  55.17 
 
 
119 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  61 
 
 
120 aa  110  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0377  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 
119 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492357  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1731  50S ribosomal protein L18  54.95 
 
 
119 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00463126  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2139  50S ribosomal protein L18P  61.11 
 
 
116 aa  110  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0432612  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2982  50S ribosomal protein L18  60.61 
 
 
120 aa  110  7.000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  62.11 
 
 
121 aa  110  8.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0947  ribosomal protein L18  57.02 
 
 
127 aa  110  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0241036  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0607  50S ribosomal protein L18  52.14 
 
 
119 aa  110  8.000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  56.48 
 
 
118 aa  110  9e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  55.86 
 
 
122 aa  110  9e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  48.33 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  62.37 
 
 
118 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 
119 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0603  ribosomal protein L18  54.39 
 
 
123 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.415443  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  52.29 
 
 
116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  52.54 
 
 
120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  53.15 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1930  ribosomal protein L18  61.26 
 
 
120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.492965  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  55.45 
 
 
122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  61.46 
 
 
120 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>