More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2048 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2048  50S ribosomal protein L18  100 
 
 		 119 aa  241  1.9999999999999999e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00722751  normal  0.437554 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2280  50S ribosomal protein L18  78.15 
 
 		 119 aa  194  4.0000000000000005e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000151304  hitchhiker  0.00323172 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  72.27 
 
 		 119 aa  183  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  70.59 
 
 		 119 aa  181  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  71.43 
 
 		 119 aa  180  5.0000000000000004e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  70.59 
 
 		 119 aa  177  5.999999999999999e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  67.23 
 
 		 119 aa  175  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  60.36 
 
 		 118 aa  129  1.0000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  56.14 
 
 		 116 aa  120  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  52.17 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  50.42 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  50.88 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 118 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 120 aa  114  3.9999999999999997e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  51.72 
 
 		 125 aa  114  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  50.86 
 
 		 120 aa  114  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  50.42 
 
 		 118 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  50.43 
 
 		 117 aa  113  6.9999999999999995e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  53.64 
 
 		 112 aa  113  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1922  50S ribosomal protein L18  49.12 
 
 		 114 aa  111  3e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 		 120 aa  111  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 120 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 124 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 122 aa  110  5e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  47.83 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  47.83 
 
 		 119 aa  110  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  50.89 
 
 		 122 aa  110  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  47.5 
 
 		 121 aa  110  6e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  49.57 
 
 		 120 aa  110  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 120 aa  110  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  52.34 
 
 		 128 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  53.92 
 
 		 121 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  47.83 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05800  RplR  58.59 
 
 		 117 aa  108  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  49.59 
 
 		 120 aa  108  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 122 aa  108  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  48.31 
 
 		 121 aa  108  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  52 
 
 		 123 aa  108  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23310  LSU ribosomal protein L18P  52.63 
 
 		 122 aa  108  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00313023  hitchhiker  0.000000983895 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  49.59 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  49.14 
 
 		 120 aa  107  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09840  LSU ribosomal protein L18P  52.21 
 
 		 122 aa  107  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0086805  hitchhiker  0.0000128953 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1494  hypothetical protein  49.14 
 
 		 116 aa  107  6e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.256346 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2758  ribosomal protein L18  51.02 
 
 		 117 aa  106  8.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00984012  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  49.09 
 
 		 112 aa  106  9.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  47.93 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  49.57 
 
 		 119 aa  106  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  44.92 
 
 		 124 aa  105  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  47.06 
 
 		 128 aa  105  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_002936  DET0490  50S ribosomal protein L18  52.78 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0095589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  47.41 
 
 		 122 aa  105  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 113 aa  105  2e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0467  50S ribosomal protein L18  52.78 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781328  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  48.33 
 
 		 118 aa  105  3e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  47.06 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0564  50S ribosomal protein L18  58.51 
 
 		 120 aa  105  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  52.53 
 
 		 122 aa  104  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2603  50S ribosomal protein L18  50.91 
 
 		 112 aa  105  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000566812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  46.09 
 
 		 120 aa  104  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  45.69 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_432  ribosomal protein L18  51.85 
 
 		 121 aa  104  4e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000158089  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  47.41 
 
 		 120 aa  104  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 120 aa  103  6e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  52.53 
 
 		 122 aa  103  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  48.18 
 
 		 116 aa  103  8e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  48.28 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4010  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000737084  hitchhiker  0.0000640833 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  49.11 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  46.43 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2202  50S ribosomal protein L18  57.45 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0988305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  56.38 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  48.28 
 
 		 120 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1169  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0336131  normal  0.0947713 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  46.49 
 
 		 120 aa  103  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  54.26 
 
 		 121 aa  102  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0241  ribosomal protein L18  56 
 
 		 123 aa  102  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.371166  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  50.91 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  46.43 
 
 		 114 aa  101  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  48.31 
 
 		 122 aa  101  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  48.21 
 
 		 122 aa  102  3e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  43.48 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  56.57 
 
 		 120 aa  101  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  45.3 
 
 		 118 aa  101  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  49.09 
 
 		 119 aa  102  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  46.09 
 
 		 120 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>