More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0863 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  100 
 
 		 121 aa  242  1.9999999999999999e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  60 
 
 		 119 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 122 aa  139  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  57.63 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  59.32 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  59.09 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  59.09 
 
 		 120 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  138  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  57.02 
 
 		 120 aa  137  3.9999999999999997e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  68.75 
 
 		 113 aa  137  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  58.54 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 120 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  137  6e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 120 aa  136  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  60 
 
 		 122 aa  134  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  59.17 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  57.26 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  55.08 
 
 		 122 aa  134  5e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 114 aa  133  7.000000000000001e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  133  8e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  64.21 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  60.91 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 124 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 122 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  64.95 
 
 		 118 aa  132  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  58.41 
 
 		 125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  59.17 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  58.47 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  52.54 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  57.27 
 
 		 118 aa  131  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  61.61 
 
 		 120 aa  130  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 121 aa  130  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  54.55 
 
 		 120 aa  130  7.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  53.28 
 
 		 124 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  59.48 
 
 		 122 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 121 aa  128  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  55 
 
 		 122 aa  128  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  58.25 
 
 		 122 aa  127  6e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2982  50S ribosomal protein L18  59.79 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0564  50S ribosomal protein L18  61.05 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 118 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  55.83 
 
 		 124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 119 aa  125  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  55.08 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 122 aa  125  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0696  50S ribosomal protein L18  59.13 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.499558  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0513  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00333829  unclonable  0.0000000000149151 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0343  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0251755  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  53.66 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  53.66 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 122 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  58.95 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0210  LSU ribosomal protein L18P  56.25 
 
 		 121 aa  123  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0545165  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  52.73 
 
 		 120 aa  123  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  56.84 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  55.46 
 
 		 121 aa  122  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  56.84 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  60.42 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  50.41 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  60.42 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  55.65 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 118 aa  121  3e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  58.18 
 
 		 120 aa  121  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1114  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19881  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  55.08 
 
 		 122 aa  121  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16631  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  52.99 
 
 		 122 aa  120  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3427  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 121 aa  120  7e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.190409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2202  50S ribosomal protein L18  55.32 
 
 		 120 aa  120  7e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0988305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1970  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 122 aa  120  8e-27  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0295  50S ribosomal protein L18  53.72 
 
 		 117 aa  120  8e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000164906  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1145  ribosomal protein L18  59.38 
 
 		 122 aa  120  8e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000000549459  normal  0.0107289 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  52.73 
 
 		 118 aa  120  8e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  52.54 
 
 		 118 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0361  50S ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 122 aa  119  9.999999999999999e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0731775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  50.85 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0301  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  50.85 
 
 		 119 aa  118  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  58.76 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0302  50S ribosomal protein L18  56.7 
 
 		 122 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000021695  normal  0.152998 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2356  50S ribosomal protein L18  52.54 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327633  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  52.73 
 
 		 112 aa  118  3e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>