More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1269 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1269  ribosomal protein L18  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3979  ribosomal protein L18  66.39 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  63.93 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  65.04 
 
 		 122 aa  151  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  62.5 
 
 		 119 aa  149  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  61.67 
 
 		 120 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  60.83 
 
 		 120 aa  144  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  61.48 
 
 		 122 aa  143  6e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  59.02 
 
 		 122 aa  143  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  62.81 
 
 		 120 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0306  50S ribosomal protein L18  62.5 
 
 		 119 aa  141  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.38344e-28 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  140  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  140  8e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 119 aa  139  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 120 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  57.38 
 
 		 124 aa  138  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  57.26 
 
 		 124 aa  137  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 118 aa  137  4.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 120 aa  137  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0610  50S ribosomal protein L18P  57.5 
 
 		 118 aa  136  7.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0267024  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  59.82 
 
 		 125 aa  136  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  57.85 
 
 		 121 aa  135  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  55 
 
 		 120 aa  134  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  56.56 
 
 		 122 aa  135  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  59.84 
 
 		 121 aa  134  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  57.85 
 
 		 121 aa  133  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01330  ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 118 aa  133  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.458183  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2630  50S ribosomal protein L18P  62.26 
 
 		 128 aa  133  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.13685  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  56.3 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  58.47 
 
 		 121 aa  131  3e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  53.33 
 
 		 120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5771  ribosomal protein L18  63.11 
 
 		 117 aa  131  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.74936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  56.2 
 
 		 121 aa  130  5e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1835  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 119 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  54.62 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0275  ribosomal protein L18  56.78 
 
 		 123 aa  128  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0485826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  57.26 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0211  50S ribosomal protein L18  57.5 
 
 		 117 aa  128  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0717  50S ribosomal protein L18  54.1 
 
 		 122 aa  127  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0402618  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 122 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  57.14 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2841  50S ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 114 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0800912  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  55.83 
 
 		 118 aa  126  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0997  50S ribosomal protein L18  59.8 
 
 		 122 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.350286  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4930  ribosomal protein L18  62.5 
 
 		 121 aa  124  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612398  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4491  ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 136 aa  124  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0234  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.875475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0237  50S ribosomal protein L18  53.78 
 
 		 120 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3146  50S ribosomal protein L18P  56.14 
 
 		 116 aa  124  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00662623  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1723  50S ribosomal protein L18  61.11 
 
 		 123 aa  123  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00474742  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3718  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  123  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2049  ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 116 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00570654  normal  0.0179917 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1749  50S ribosomal protein L18  55.46 
 
 		 119 aa  123  8.000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.637683 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3312  50S ribosomal protein L18  51.64 
 
 		 122 aa  123  1e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000452303 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl139  50S ribosomal protein L18  54.7 
 
 		 115 aa  122  1e-27  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  55.86 
 
 		 120 aa  123  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2213  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 119 aa  122  1e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000234169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  65.66 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1168  ribosomal protein L18  63.64 
 
 		 113 aa  122  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.257071  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  65.66 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0642  50S ribosomal protein L18  52.17 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000862342  hitchhiker  0.0000000324401 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  55.37 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  50.83 
 
 		 119 aa  122  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  57.27 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0305  50S ribosomal protein L18  49.58 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.413782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5031  50S ribosomal protein L18  54.39 
 
 		 136 aa  120  4e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00000697313  normal  0.548641 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0197  50S ribosomal protein L18  51.26 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.326686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4305  ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 127 aa  120  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  52.73 
 
 		 119 aa  120  5e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1338  50S ribosomal protein L18  53.51 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  0.000353034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0598  50S ribosomal protein L18  52.63 
 
 		 124 aa  120  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0231  50S ribosomal protein L18  55.74 
 
 		 122 aa  120  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00019392  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0680  50S ribosomal protein L18  53.15 
 
 		 116 aa  120  8e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2202  50S ribosomal protein L18  63.83 
 
 		 120 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0988305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  62.5 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  61.05 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  62.11 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  62.11 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0618  ribosomal protein L18  54.24 
 
 		 117 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.969603 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  61.29 
 
 		 118 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  55.26 
 
 		 124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1082  50S ribosomal protein L18  53.1 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5140  ribosomal protein L18  51.75 
 
 		 126 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.642153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1102  LSU ribosomal protein L18P  53.77 
 
 		 127 aa  117  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0571737 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1571  ribosomal protein L18  62 
 
 		 123 aa  117  4.9999999999999996e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.246987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2407  50S ribosomal protein L18  47.9 
 
 		 119 aa  117  4.9999999999999996e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0221783  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0343  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0251755  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0513  50S ribosomal protein L18  51.69 
 
 		 117 aa  117  6e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.00333829  unclonable  0.0000000000149151 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>