More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2752 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2752  ribosomal protein L18  100 
 
 		 118 aa  235  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.333327  normal  0.200711 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1662  50S ribosomal protein L18P  69.37 
 
 		 119 aa  142  2e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130652  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1779  50S ribosomal protein L18P  63.33 
 
 		 120 aa  140  4e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297069  normal  0.117381 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5054  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.570149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0714  50S ribosomal protein L18  57.5 
 
 		 120 aa  136  1e-31  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0742927  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1630  50S ribosomal protein L18  66.06 
 
 		 118 aa  135  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.473609  normal  0.181454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1002  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  135  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.168724  hitchhiker  0.00975315 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3651  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3432  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  134  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.23776  normal  0.3359 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1348  50S ribosomal protein L18  60.83 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0000432903  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0564  50S ribosomal protein L18  69.47 
 
 		 120 aa  132  9.999999999999999e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2148  50S ribosomal protein L18  63.33 
 
 		 120 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1380  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.794975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2311  50S ribosomal protein L18  57.5 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0992173  normal  0.451377 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3168  50S ribosomal protein L18  57.5 
 
 		 120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.411824  normal  0.450059 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1561  50S ribosomal protein L18  57.5 
 
 		 120 aa  131  3e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.467106  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1446  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  131  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.267488 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1924  50S ribosomal protein L18  70.53 
 
 		 120 aa  130  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.845183  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0774  ribosomal protein L18  55.08 
 
 		 122 aa  130  6.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0123  50S ribosomal protein L18  63.44 
 
 		 120 aa  129  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2672  50S ribosomal protein L18P  57.5 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.159839  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1370  50S ribosomal protein L18  60.18 
 
 		 120 aa  128  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.358563  normal  0.126509 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2463  50S ribosomal protein L18  71.58 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.212338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0120  50S ribosomal protein L18  57.27 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000542863  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2185  50S ribosomal protein L18  71.58 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.954863  normal  0.731843 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0337  50S ribosomal protein L18  70.53 
 
 		 120 aa  128  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1508  50S ribosomal protein L18  58.12 
 
 		 121 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.175326  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2202  50S ribosomal protein L18  70.21 
 
 		 120 aa  127  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0988305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0731  ribosomal protein L18  59.82 
 
 		 125 aa  127  7.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0138  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.4273e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0126  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000140079  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0126  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139258  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0122  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000109989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0120  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000618216  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0147  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000702498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0126  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0315012  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4359  ribosomal protein L18  55.93 
 
 		 117 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000257389  normal  0.0751525 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0157  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000109054  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4782  50S ribosomal protein L18  59.32 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127323  hitchhiker  0.000000074744 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0127  50S ribosomal protein L18  61.29 
 
 		 120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1180  50S ribosomal protein L18  72.63 
 
 		 120 aa  124  3e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.203306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0858  ribosomal protein L18  56.67 
 
 		 119 aa  125  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5179  50S ribosomal protein L18  56.36 
 
 		 120 aa  125  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311819  unclonable  1.18579e-25 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1467  50S ribosomal protein L18  56.25 
 
 		 118 aa  124  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000595755  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0121  50S ribosomal protein L18  55.45 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000538516  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1972  50S ribosomal protein L18  71.58 
 
 		 120 aa  124  6e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.000177032  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2444  50S ribosomal protein L18P  57.39 
 
 		 121 aa  123  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.96892 
 
 
-
 
NC_004310  BR1217  50S ribosomal protein L18  71.58 
 
 		 120 aa  122  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1815  50S ribosomal protein L18  54.13 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1337  50S ribosomal protein L18  64.89 
 
 		 118 aa  122  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.150956 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0883  50S ribosomal protein L18  55.08 
 
 		 121 aa  122  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.418113  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0724  ribosomal protein L18  54.17 
 
 		 124 aa  121  3e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.111204  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1851  50S ribosomal protein L18  63.3 
 
 		 112 aa  121  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.662264 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2698  50S ribosomal protein L18  56.41 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2383  50S ribosomal protein L18  56.41 
 
 		 119 aa  121  3e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3008  50S ribosomal protein L18  58.26 
 
 		 120 aa  120  4e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156671  hitchhiker  0.00901101 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1857  50S ribosomal protein L18  58.33 
 
 		 120 aa  120  5e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.58959  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1891  50S ribosomal protein L18  58.93 
 
 		 118 aa  120  5e-27  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.865797  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0607  50S ribosomal protein L18  51.75 
 
 		 119 aa  120  6e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2891  ribosomal protein L18  58.82 
 
 		 112 aa  120  8e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2695  ribosomal protein L18  55.56 
 
 		 119 aa  120  8e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0863  50S ribosomal protein L18P  52.73 
 
 		 121 aa  120  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00546241  hitchhiker  0.0054851 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1122  ribosomal protein L18  60 
 
 		 122 aa  120  9e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.805171  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0381  ribosomal protein L18  57.27 
 
 		 116 aa  119  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.958382  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2302  50S ribosomal protein L18  55.96 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0220849  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2261  50S ribosomal protein L18  55.96 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00249191  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0775  50S ribosomal protein L18  56.03 
 
 		 119 aa  119  9.999999999999999e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.292736  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2982  50S ribosomal protein L18  67.37 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.864504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2217  50S ribosomal protein L18  64.21 
 
 		 120 aa  119  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.442401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0270  50S ribosomal protein L18  53.85 
 
 		 119 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0524919  normal  0.432762 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1378  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0119582  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0074  50S ribosomal protein L18  57.14 
 
 		 118 aa  118  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.966065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0706  50S ribosomal protein L18  54.46 
 
 		 120 aa  118  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000504342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1308  50S ribosomal protein L18  63.16 
 
 		 122 aa  118  3e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000199642  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6033  50S ribosomal protein L18  56.14 
 
 		 124 aa  118  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.133993 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0210  LSU ribosomal protein L18P  60 
 
 		 121 aa  117  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0545165  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1729  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 124 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000500708  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2997  50S ribosomal protein L18  61.05 
 
 		 120 aa  117  6e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.331277  normal  0.0205603 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2574  50S ribosomal protein L18  54.46 
 
 		 120 aa  117  6e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2919  50S ribosomal protein L18P  65.26 
 
 		 122 aa  116  9e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000202022  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1163  ribosomal protein L18  51.33 
 
 		 118 aa  116  9e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000618231  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0969  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 		 122 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0301  50S ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 119 aa  115  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.525651 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1242  50S ribosomal protein L18P  57.73 
 
 		 124 aa  116  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0425166  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1635  50S ribosomal protein L18  50 
 
 		 122 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1631  ribosomal protein L18  53.98 
 
 		 117 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2317  ribosomal protein L18  53.39 
 
 		 121 aa  115  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00125147  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0322  50S ribosomal protein L18P  56.07 
 
 		 128 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00166637 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0302  50S ribosomal protein L18  58.95 
 
 		 122 aa  115  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000021695  normal  0.152998 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1731  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00463126  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0377  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 		 119 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2518  50S ribosomal protein L18  52.1 
 
 		 119 aa  114  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0774  ribosomal protein L18  52.94 
 
 		 122 aa  114  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000026259  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17341  50S ribosomal protein L18  52.14 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.837356  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17501  50S ribosomal protein L18  51.28 
 
 		 122 aa  114  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2802  50S ribosomal protein L18  55.93 
 
 		 117 aa  114  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.449731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1307  50S ribosomal protein L18  60 
 
 		 120 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.344119  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1852  ribosomal protein L18  48.7 
 
 		 118 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000002579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3651  50S ribosomal protein L18  58.76 
 
 		 122 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000455959  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2960  50S ribosomal protein L18P  53.21 
 
 		 127 aa  112  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00477287  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>