More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0450 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_0450  amino acid carrier protein  100 
 
 		 458 aa  882    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.829579  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0880  amino acid carrier protein  64.15 
 
 		 458 aa  503  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  44.1 
 
 		 454 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  38.8 
 
 		 458 aa  318  1e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  43.9 
 
 		 460 aa  314  1.9999999999999998e-84  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  42.36 
 
 		 458 aa  314  1.9999999999999998e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  43.33 
 
 		 450 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  42.99 
 
 		 458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  42.99 
 
 		 458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  42.99 
 
 		 458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  42.99 
 
 		 458 aa  307  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  43.02 
 
 		 457 aa  307  3e-82  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  39.08 
 
 		 460 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  43.31 
 
 		 456 aa  306  7e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  42.31 
 
 		 458 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  39.43 
 
 		 455 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  41 
 
 		 459 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  38.95 
 
 		 455 aa  299  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  42.79 
 
 		 457 aa  299  9e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  39.21 
 
 		 455 aa  298  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  44.02 
 
 		 456 aa  298  2e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  38.77 
 
 		 455 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  38.77 
 
 		 455 aa  298  2e-79  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  41.63 
 
 		 459 aa  296  4e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  38.99 
 
 		 455 aa  296  4e-79  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  38.55 
 
 		 455 aa  296  4e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  40.36 
 
 		 449 aa  296  6e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  38.55 
 
 		 455 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  38.55 
 
 		 455 aa  296  7e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  38.55 
 
 		 455 aa  295  1e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  44.09 
 
 		 449 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  40.27 
 
 		 443 aa  288  9e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  38.63 
 
 		 460 aa  288  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  40.63 
 
 		 459 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  43.18 
 
 		 464 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  43.05 
 
 		 467 aa  283  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  40.67 
 
 		 455 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  44.24 
 
 		 453 aa  281  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  41.13 
 
 		 459 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  36.5 
 
 		 457 aa  280  3e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1133  amino acid carrier protein  39.69 
 
 		 456 aa  280  3e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  42.73 
 
 		 459 aa  276  5e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  37.83 
 
 		 463 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  36.4 
 
 		 462 aa  274  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  40.36 
 
 		 447 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  38.05 
 
 		 460 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  41.96 
 
 		 464 aa  274  3e-72  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  38.34 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  36.18 
 
 		 462 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  45.15 
 
 		 447 aa  272  8.000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  40.53 
 
 		 468 aa  272  9e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  43.96 
 
 		 445 aa  272  1e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  42.58 
 
 		 446 aa  271  1e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  40 
 
 		 464 aa  271  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  41.39 
 
 		 452 aa  266  5.999999999999999e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  37.19 
 
 		 448 aa  265  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  36.54 
 
 		 456 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  39.64 
 
 		 445 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  35.94 
 
 		 443 aa  262  8e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  40.26 
 
 		 453 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  41.33 
 
 		 456 aa  261  2e-68  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  42.32 
 
 		 461 aa  259  7e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  36.09 
 
 		 458 aa  259  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  39.82 
 
 		 453 aa  258  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  40.27 
 
 		 458 aa  258  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  37.25 
 
 		 476 aa  257  3e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  37.33 
 
 		 458 aa  256  6e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  38.3 
 
 		 457 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  37.92 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  36.01 
 
 		 458 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  37.56 
 
 		 464 aa  254  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  37.25 
 
 		 452 aa  253  6e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12690  amino acid carrier protein  36.56 
 
 		 498 aa  251  3e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2730  amino acid carrier protein  34.45 
 
 		 469 aa  250  3e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227579  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  32.03 
 
 		 472 aa  250  4e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  37.47 
 
 		 452 aa  250  4e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  40.55 
 
 		 435 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  37.8 
 
 		 452 aa  249  6e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  36.52 
 
 		 456 aa  249  8e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  36.78 
 
 		 452 aa  249  8e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  37.47 
 
 		 459 aa  249  8e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  37.81 
 
 		 457 aa  248  1e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  36.47 
 
 		 456 aa  247  3e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  36.95 
 
 		 452 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  36.95 
 
 		 452 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  36.95 
 
 		 452 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  37.02 
 
 		 452 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  38.95 
 
 		 424 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  37.04 
 
 		 490 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  34.06 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  38.18 
 
 		 448 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1259  amino acid carrier family protein  31.63 
 
 		 474 aa  244  3e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000459573  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  34.74 
 
 		 492 aa  244  3e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  35.34 
 
 		 505 aa  243  3.9999999999999997e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0060  amino acid carrier protein  35.82 
 
 		 503 aa  241  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.706762 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  38.3 
 
 		 443 aa  238  1e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  34.73 
 
 		 451 aa  237  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  34.53 
 
 		 447 aa  236  6e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  38.69 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  36.97 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>