More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0880 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_0880  amino acid carrier protein  100 
 
 		 458 aa  880    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.770189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0450  amino acid carrier protein  64.15 
 
 		 458 aa  542  1e-153  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.829579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  43.7 
 
 		 454 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  40.8 
 
 		 458 aa  322  7e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  43.21 
 
 		 460 aa  320  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  42.02 
 
 		 459 aa  309  8e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  40.35 
 
 		 460 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  39.95 
 
 		 457 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  41.48 
 
 		 456 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  41.8 
 
 		 457 aa  296  5e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  41.08 
 
 		 459 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  40.79 
 
 		 458 aa  293  5e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  37.14 
 
 		 455 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  37.14 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  37.14 
 
 		 455 aa  288  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  40.49 
 
 		 450 aa  288  1e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  36.91 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  37.14 
 
 		 455 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  36.69 
 
 		 455 aa  286  5e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  39.86 
 
 		 458 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  39.86 
 
 		 458 aa  285  8e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  39.86 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  39.86 
 
 		 458 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  40.54 
 
 		 459 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  39.86 
 
 		 458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  36.47 
 
 		 455 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  36.47 
 
 		 455 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  41.04 
 
 		 449 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  36.69 
 
 		 455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  36.59 
 
 		 455 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  40.24 
 
 		 459 aa  282  1e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  38.36 
 
 		 457 aa  280  4e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  41.39 
 
 		 459 aa  280  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  41.22 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  40.59 
 
 		 464 aa  277  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  41.1 
 
 		 449 aa  277  3e-73  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  41.22 
 
 		 453 aa  276  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  39.02 
 
 		 443 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  42.34 
 
 		 447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1259  amino acid carrier family protein  37.92 
 
 		 474 aa  275  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000459573  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  42.08 
 
 		 446 aa  274  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  41.1 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  40.09 
 
 		 458 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  41.91 
 
 		 467 aa  269  8.999999999999999e-71  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  39.29 
 
 		 443 aa  268  1e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  37.64 
 
 		 464 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  40.61 
 
 		 464 aa  265  1e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  38.29 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1133  amino acid carrier protein  37.44 
 
 		 456 aa  263  6e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  37.87 
 
 		 472 aa  260  3e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  37.61 
 
 		 445 aa  260  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  37.72 
 
 		 455 aa  259  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2730  amino acid carrier protein  37.5 
 
 		 469 aa  258  1e-67  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227579  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  37.2 
 
 		 451 aa  258  2e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  39.38 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  41.42 
 
 		 461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  36.03 
 
 		 441 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  36.88 
 
 		 448 aa  254  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  38.53 
 
 		 476 aa  253  5.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  38.94 
 
 		 453 aa  253  6e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  34.38 
 
 		 460 aa  251  2e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  40.37 
 
 		 435 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  37.3 
 
 		 448 aa  251  3e-65  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  40.22 
 
 		 456 aa  248  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  35.43 
 
 		 463 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  38.91 
 
 		 458 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  37.31 
 
 		 452 aa  246  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  40.04 
 
 		 452 aa  246  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  36.26 
 
 		 460 aa  246  6e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  36.21 
 
 		 456 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  33.85 
 
 		 462 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  33.85 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  36.4 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  36.18 
 
 		 452 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  36.4 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  36.4 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  36.4 
 
 		 452 aa  244  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  37.64 
 
 		 459 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  34.16 
 
 		 456 aa  242  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  35.96 
 
 		 452 aa  242  1e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  39.07 
 
 		 470 aa  241  1e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  36.18 
 
 		 452 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  36.06 
 
 		 452 aa  242  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2251  sodium:alanine symporter  38.72 
 
 		 490 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  35.56 
 
 		 457 aa  241  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  35.67 
 
 		 464 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  38.33 
 
 		 487 aa  240  4e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2725  sodium:alanine symporter  39.05 
 
 		 502 aa  239  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  38.79 
 
 		 443 aa  239  6.999999999999999e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  31.96 
 
 		 458 aa  238  2e-61  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  35.24 
 
 		 468 aa  237  3e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0109  amino acid carrier protein  35.78 
 
 		 505 aa  234  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.108225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2069  amino acid carrier protein  35.33 
 
 		 502 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0217883  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  37.06 
 
 		 456 aa  233  5e-60  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  31.93 
 
 		 458 aa  232  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1871  amino acid carrier protein  35.23 
 
 		 524 aa  231  2e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.766139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  38.19 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  34.75 
 
 		 447 aa  230  4e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  38.15 
 
 		 458 aa  229  9e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  35.18 
 
 		 456 aa  228  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>