More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_0163 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0163  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
316 aa  600  1.0000000000000001e-171  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.585262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.45 
 
 
315 aa  298  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3127  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.16 
 
 
319 aa  296  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2499  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.51 
 
 
334 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0750217 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3841  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 
316 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00994535  normal  0.14386 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5358  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  45.86 
 
 
315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0386  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.53 
 
 
312 aa  285  5e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1505  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.68 
 
 
315 aa  285  8e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0708639  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4576  peptide ABC transporter permease  47.02 
 
 
318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752948  hitchhiker  0.00438876 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.21 
 
 
334 aa  284  2.0000000000000002e-75  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000955673 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2679  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  49.68 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0387434  normal  0.596801 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2849  ABC transporter permease protein  45.86 
 
 
313 aa  282  5.000000000000001e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.585703  normal  0.643564 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0984  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.77 
 
 
313 aa  280  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.422815  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2641  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.75 
 
 
332 aa  279  5e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2453  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.45 
 
 
334 aa  278  7e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.17389  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2404  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.26 
 
 
308 aa  278  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311261  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0113  nickel-transporting ATPase  44.94 
 
 
336 aa  278  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2757  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.77 
 
 
306 aa  277  1e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4966  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.57 
 
 
318 aa  276  2e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.142025  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0010  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.2 
 
 
308 aa  275  6e-73  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0918  inner membrane ABC transporter permease protein YddR  44.3 
 
 
306 aa  275  9e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.145156  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0980  glutathione ABC transporter permease  44.3 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0891  glutathione ABC transporter, permease protein  44.3 
 
 
306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.976092  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1001  glutathione ABC transporter permease  44.3 
 
 
306 aa  275  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0951  glutathione ABC transporter permease  44.3 
 
 
306 aa  274  1.0000000000000001e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.258662  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1325  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.72 
 
 
311 aa  272  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3039  nickel-transporting ATPase  45.37 
 
 
336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.408808 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1184  dipeptide ABC transporter, permease protein  41.32 
 
 
333 aa  272  6e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0134333  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1092  peptide ABC transporter, permease protein, putative  46.2 
 
 
314 aa  271  1e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3846  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.2 
 
 
307 aa  270  2e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.089816 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1444  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.8 
 
 
314 aa  270  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.935308  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0933  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.86 
 
 
313 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3774  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.98 
 
 
320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.542684  normal  0.67395 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3402  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.48 
 
 
322 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.414511 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6391  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, inner membrane subunit  45.07 
 
 
336 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3392  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.48 
 
 
322 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3454  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.48 
 
 
322 aa  269  4e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0476049  normal  0.20897 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3801  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.57 
 
 
314 aa  269  5e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2382  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.41 
 
 
314 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0846884  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3891  ABC di/oligopeptide transporter, inner membrane subunit  48.24 
 
 
317 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0754  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.36 
 
 
313 aa  268  7e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0546452  normal  0.293815 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2955  alkaline phosphatase  45.07 
 
 
336 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2430  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
336 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4148  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  48.24 
 
 
317 aa  268  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.627017 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3089  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.48 
 
 
336 aa  268  1e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.78 
 
 
336 aa  268  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1670  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.15 
 
 
335 aa  267  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.851486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1409  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.08 
 
 
313 aa  267  2e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0709141  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3805  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  49.84 
 
 
321 aa  267  2e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000414077  hitchhiker  0.00173265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4340  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.94 
 
 
313 aa  267  2e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.465915  normal  0.951896 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3063  alkaline phosphatase  44.78 
 
 
336 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273839 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0066  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.67 
 
 
334 aa  267  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0139  dipeptide transporter permease DppB  44.25 
 
 
351 aa  267  2e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3905  dipeptide transporter permease DppB  43.95 
 
 
339 aa  266  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4367  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.08 
 
 
313 aa  265  5e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.380096  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2054  peptide ABC transporter permease  43.58 
 
 
336 aa  265  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0359637  normal  0.365039 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5290  ABC transporter membrane spanning protein (oligopeptide)  46.13 
 
 
307 aa  265  8e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.728282  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3906  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  265  8.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3827  dipeptide transporter permease DppB  43.66 
 
 
339 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4009  dipeptide transporter permease DppB  43.66 
 
 
339 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3841  dipeptide transporter permease DppB  43.66 
 
 
339 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3949  dipeptide transporter permease DppB  43.66 
 
 
339 aa  264  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2003  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.23 
 
 
315 aa  265  1e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.872908 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5082  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 
314 aa  263  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0845824 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0131  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.59 
 
 
316 aa  263  2e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0880861  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.81 
 
 
313 aa  263  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.18227  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4024  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.4 
 
 
313 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.932563 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0311  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.13 
 
 
313 aa  263  2e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2913  nickel-transporting ATPase  44.05 
 
 
337 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0050  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  263  3e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.969756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0045  dipeptide transporter permease DppB  42.77 
 
 
339 aa  263  4e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0369  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  47.78 
 
 
316 aa  263  4e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4239  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.56 
 
 
336 aa  262  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0349667  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  51.91 
 
 
314 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.409377 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  44.87 
 
 
313 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0910692  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2357  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  42.26 
 
 
336 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0452163  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2760  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  46.3 
 
 
316 aa  262  6e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03394  dipeptide transporter  43.07 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0169  Alkaline phosphatase  43.07 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1381  transmembrane ABC transporter protein  41.77 
 
 
307 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.796345  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0172  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03345  hypothetical protein  43.07 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4035  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3988  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3742  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2812  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.35 
 
 
336 aa  262  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.532586  normal  0.117752 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3862  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
339 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00798  predicted peptide transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  41.77 
 
 
306 aa  261  8e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.472093  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2811  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.77 
 
 
306 aa  261  8e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.473558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1434  peptide ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
326 aa  261  8e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.393954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4911  dipeptide transporter permease DppB  43.07 
 
 
381 aa  261  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0902  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  41.77 
 
 
306 aa  261  8e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2813  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.77 
 
 
306 aa  261  8e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3926  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  45.08 
 
 
313 aa  261  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18831  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3104  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.22 
 
 
306 aa  261  8e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0856  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  41.77 
 
 
306 aa  261  8e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00815  hypothetical protein  41.77 
 
 
306 aa  261  8e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.558182  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0185  dipeptide transporter permease DppB  43.36 
 
 
339 aa  261  8e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.446355  normal  0.432086 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0889  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  41.77 
 
 
306 aa  261  8e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.952014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0982  glutathione ABC transporter, permease protein GsiC  41.77 
 
 
306 aa  261  8.999999999999999e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>