84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4228 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4228  HupE/UreJ protein  100 
 
 		 217 aa  410  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1026  HupE/UreJ protein  41.03 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3141  hypothetical protein  48.55 
 
 		 210 aa  144  9e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1373  hydrogenase accessory protein  42.29 
 
 		 231 aa  141  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.695906  normal  0.247708 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2139  HupE/UreJ protein  44.09 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2095  HupE/UreJ protein  43.55 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5052  HupE/UreJ protein  40.88 
 
 		 211 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.864731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3578  HupE/UreJ protein  38.15 
 
 		 192 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.567629  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4304  hypothetical protein  37.57 
 
 		 191 aa  77  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4085  HupE/UreJ protein  37.57 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3892  HupE/UreJ protein  37.57 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430028 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3991  HupE/UreJ protein  37.57 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3969  HupE/UreJ protein  37.57 
 
 		 192 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4241  HupE/UreJ protein  37.77 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0396  HupE/UreJ protein  36.42 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3629  HupE/UreJ protein  36.42 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0223294  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2034  urease accessory UREJ transmembrane protein  36.87 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0395  HupE/UreJ protein  35.84 
 
 		 192 aa  72  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347304  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03731  hypothetical protein  35.86 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1210  HupE/UreJ protein  37.28 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0959  HupE/UreJ protein  32.97 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355166  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4125  urease accessory protein UreJ  31.95 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.4167 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2825  HupE/UreJ protein  33.95 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1863  HupE/UreJ protein  33.13 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.867351  normal  0.454948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1763  HupE/UreJ protein  37.76 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.353058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12311  putative hydrogenase accessory protein  34.03 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2011  putative hydrogenase accessory protein  37.67 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0993  HupE/UreJ protein  35.52 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3272  urease accessory protein UreJ  32.32 
 
 		 194 aa  62  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0327  HupE/UreJ protein  38.51 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.994931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2186  HupE/UreJ protein  34.34 
 
 		 205 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114509 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14481  hypothetical protein  34.55 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1592  putative hydrogenase accessory protein  33.33 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.150539  hitchhiker  0.00246904 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0621  hydrogenase accessory membrane protein  35.17 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3374  hypothetical protein  37.14 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.215673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1184  HupE/UreJ protein  30.95 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0886  HupE/UreJ protein  32.89 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.219262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3268  urease accessory protein  38.89 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232463  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5085  HupE/UreJ protein  37.1 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893105  normal  0.0304442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2290  HupE/UreJ protein  33.17 
 
 		 192 aa  58.2  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.223499 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2989  HupE/UreJ protein  32.12 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.231706  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3799  HupE/UreJ protein  31.18 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414571  normal  0.346057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0164  nickel-iron hydrogenase, accessory protein  34.69 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1953  hydrogenase accessory protein  29.92 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.776379  normal  0.376747 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5001  HupE/UreJ protein  34.78 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.66529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50400  HupE/UreJ protein  37.01 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0960  HupE/UreJ protein  31.76 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0663  HupE/UreJ protein  37.5 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.32608  normal  0.0353183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3527  HupE/UreJ protein  42.34 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162722 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1158  HupE/UreJ protein  36.07 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160824  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21111  putative hydrogenase accessory protein  32.19 
 
 		 187 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.543051 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2281  HupE/UreJ protein  35.66 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6538  HupE/UreJ protein  38.22 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436397  normal  0.193844 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5110  HupE/UreJ protein  31.91 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.774333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2148  HupE/UreJ protein  34.48 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.140678  normal  0.213077 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2301  HupE/UreJ protein  30.18 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2933  HupE/UreJ protein  32.58 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.629521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2438  HupE/UreJ protein  34.75 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0479  hydrogenase/urease accessory protein  36.54 
 
 		 166 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230165  normal  0.16849 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0497  HupE/UreJ accessory protein  33.91 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6126  HupE/UreJ protein  35.88 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549865  normal  0.331316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0560  HupE/UreJ protein  40.62 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0830  urease accessory protein  31.71 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0333  HupE/UreJ protein  32.93 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.836087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2847  HupE/UreJ protein  31.06 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.16808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2123  HupE/UreJ protein  36.89 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1290  hypothetical protein  37.31 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2842  HupE/UreJ protein  31.06 
 
 		 181 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1166  HupE/UreJ protein  36.07 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0976  HupE/UreJ protein  39.57 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64680  hypothetical protein  32.74 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0396536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1973  HupE/UreJ protein  36.45 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.374971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1195  HupE/UreJ protein  30 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108904  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4912  urease accessory protein, putative  35.12 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1164  HupE/UreJ protein  29.94 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5617  hypothetical protein  38.32 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1218  hypothetical protein  29.91 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4454  HupE/UreJ protein  38.46 
 
 		 190 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5823  HupE/UreJ protein  30.58 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3245  urease accessory protein UreJ  27.11 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2419  HupE/UreJ protein  36.11 
 
 		 181 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00415524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3747  HupE/UreJ protein  36.45 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4087  HupE/UreJ protein  31.18 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.248426  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3099  HupE/UreJ protein  27.33 
 
 		 194 aa  42  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>