81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1026 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_1026  HupE/UreJ protein  100 
 
 		 226 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2095  HupE/UreJ protein  43.96 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2139  HupE/UreJ protein  43 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4228  HupE/UreJ protein  41.03 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1373  hydrogenase accessory protein  39.01 
 
 		 231 aa  147  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.695906  normal  0.247708 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5052  HupE/UreJ protein  47.51 
 
 		 211 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.864731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3141  hypothetical protein  36.81 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1953  hydrogenase accessory protein  34.13 
 
 		 216 aa  91.7  8e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.776379  normal  0.376747 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12311  putative hydrogenase accessory protein  31.98 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2011  putative hydrogenase accessory protein  32.16 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14481  hypothetical protein  30.82 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0621  hydrogenase accessory membrane protein  31.21 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4125  urease accessory protein UreJ  33.33 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.4167 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2290  HupE/UreJ protein  37.5 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.223499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1184  HupE/UreJ protein  34.62 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3629  HupE/UreJ protein  31.4 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0223294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3578  HupE/UreJ protein  32.23 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.567629  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03731  hypothetical protein  30.82 
 
 		 209 aa  61.6  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0960  HupE/UreJ protein  35.64 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0395  HupE/UreJ protein  31.4 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347304  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3991  HupE/UreJ protein  33.88 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50400  HupE/UreJ protein  31.62 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21111  putative hydrogenase accessory protein  40.71 
 
 		 187 aa  60.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.543051 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1166  HupE/UreJ protein  36.29 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0396  HupE/UreJ protein  31.4 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1158  HupE/UreJ protein  37.01 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160824  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3892  HupE/UreJ protein  33.06 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430028 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3969  HupE/UreJ protein  33.06 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4085  HupE/UreJ protein  33.06 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1763  HupE/UreJ protein  31.69 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.353058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1592  putative hydrogenase accessory protein  30.95 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.150539  hitchhiker  0.00246904 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0663  HupE/UreJ protein  29.14 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.32608  normal  0.0353183 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0993  HupE/UreJ protein  28.92 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614894  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3272  urease accessory protein UreJ  36.46 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3799  HupE/UreJ protein  29.45 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414571  normal  0.346057 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6126  HupE/UreJ protein  34.62 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549865  normal  0.331316 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5617  hypothetical protein  33.03 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2281  HupE/UreJ protein  36.89 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5085  HupE/UreJ protein  39.32 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893105  normal  0.0304442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4304  hypothetical protein  29.75 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2825  HupE/UreJ protein  37.1 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2123  HupE/UreJ protein  32.94 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0164  nickel-iron hydrogenase, accessory protein  33.33 
 
 		 192 aa  54.7  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2876  HupE/UreJ protein  35.94 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0479  hydrogenase/urease accessory protein  38.38 
 
 		 166 aa  52.4  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230165  normal  0.16849 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1290  hypothetical protein  31.29 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3268  urease accessory protein  33.33 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232463  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6538  HupE/UreJ protein  34.96 
 
 		 199 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436397  normal  0.193844 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5110  HupE/UreJ protein  31.82 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.774333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0560  HupE/UreJ protein  35.42 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0327  HupE/UreJ protein  33.06 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.994931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1265  urease accessory protein UreJ  35.2 
 
 		 189 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0333  HupE/UreJ protein  35.59 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.836087  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0886  HupE/UreJ protein  30.87 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.219262  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4912  urease accessory protein, putative  33.09 
 
 		 190 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0959  HupE/UreJ protein  27.21 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355166  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5823  HupE/UreJ protein  31.71 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4241  HupE/UreJ protein  29.05 
 
 		 199 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64680  hypothetical protein  32.11 
 
 		 190 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0396536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2438  HupE/UreJ protein  35.59 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0830  urease accessory protein  33.98 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3943  HupE/UreJ protein  36.96 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.788882  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1863  HupE/UreJ protein  33.04 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.867351  normal  0.454948 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2682  HupE/UreJ protein  34.31 
 
 		 194 aa  47  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.669277  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2301  HupE/UreJ protein  28.74 
 
 		 201 aa  46.6  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5001  HupE/UreJ protein  32.33 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.66529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1164  HupE/UreJ protein  27.88 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3245  urease accessory protein UreJ  28.74 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3099  HupE/UreJ protein  31.5 
 
 		 194 aa  45.8  0.0005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1210  HupE/UreJ protein  29.8 
 
 		 186 aa  45.8  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2989  HupE/UreJ protein  29.71 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.231706  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1218  hypothetical protein  32.48 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2188  HupE/UreJ protein  36.89 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1195  HupE/UreJ protein  28.93 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108904  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2186  HupE/UreJ protein  33.93 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114509 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3747  HupE/UreJ protein  34.62 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4454  HupE/UreJ protein  34.81 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2034  urease accessory UREJ transmembrane protein  28.91 
 
 		 205 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3527  HupE/UreJ protein  30.77 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.162722 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2847  HupE/UreJ protein  32.5 
 
 		 181 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.16808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2842  HupE/UreJ protein  32.5 
 
 		 181 aa  42.7  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.616915  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>