18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_1592 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_1592  putative hydrogenase accessory protein  100 
 
 		 210 aa  394  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.150539  hitchhiker  0.00246904 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2011  putative hydrogenase accessory protein  73.76 
 
 		 210 aa  262  3e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03731  hypothetical protein  62.84 
 
 		 209 aa  237  8e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14481  hypothetical protein  58.21 
 
 		 204 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0621  hydrogenase accessory membrane protein  62.5 
 
 		 210 aa  216  2e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21111  putative hydrogenase accessory protein  62.37 
 
 		 187 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.543051 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12311  putative hydrogenase accessory protein  54.64 
 
 		 234 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2095  HupE/UreJ protein  35.29 
 
 		 221 aa  88.2  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2139  HupE/UreJ protein  34.95 
 
 		 221 aa  86.3  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3141  hypothetical protein  40.94 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1373  hydrogenase accessory protein  30.43 
 
 		 231 aa  71.6  0.000000000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.695906  normal  0.247708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4228  HupE/UreJ protein  33.52 
 
 		 217 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1026  HupE/UreJ protein  29.02 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5052  HupE/UreJ protein  32.34 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.864731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3799  HupE/UreJ protein  30.99 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414571  normal  0.346057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0164  nickel-iron hydrogenase, accessory protein  32.35 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3245  urease accessory protein UreJ  31.18 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3196  hypothetical protein  26.44 
 
 		 244 aa  41.6  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>