73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2139 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2139  HupE/UreJ protein  100 
 
 
221 aa  424  1e-118  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2095  HupE/UreJ protein  96.38 
 
 
221 aa  413  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1026  HupE/UreJ protein  43 
 
 
226 aa  163  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1373  hydrogenase accessory protein  45.27 
 
 
231 aa  152  5e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.695906  normal  0.247708 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4228  HupE/UreJ protein  44.09 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5052  HupE/UreJ protein  40.53 
 
 
211 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.864731  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3141  hypothetical protein  38.12 
 
 
210 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12311  putative hydrogenase accessory protein  31.12 
 
 
234 aa  80.1  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1592  putative hydrogenase accessory protein  34.1 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.150539  hitchhiker  0.00246904 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03731  hypothetical protein  35.48 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2011  putative hydrogenase accessory protein  31.03 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1953  hydrogenase accessory protein  30.68 
 
 
216 aa  72.8  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.776379  normal  0.376747 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0395  HupE/UreJ protein  33.51 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.347304  normal  0.406165 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0396  HupE/UreJ protein  33.67 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3578  HupE/UreJ protein  33.16 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.567629  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3629  HupE/UreJ protein  33.67 
 
 
192 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0223294  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0621  hydrogenase accessory membrane protein  34.48 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4304  hypothetical protein  33.16 
 
 
191 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3991  HupE/UreJ protein  32.16 
 
 
192 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4085  HupE/UreJ protein  31.66 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3892  HupE/UreJ protein  31.66 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430028 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21111  putative hydrogenase accessory protein  33.55 
 
 
187 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.543051 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3969  HupE/UreJ protein  31.66 
 
 
192 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14481  hypothetical protein  33.57 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6126  HupE/UreJ protein  32.35 
 
 
199 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.549865  normal  0.331316 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6538  HupE/UreJ protein  31.55 
 
 
199 aa  61.6  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436397  normal  0.193844 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1195  HupE/UreJ protein  32.42 
 
 
210 aa  60.8  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.108904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1290  hypothetical protein  34.59 
 
 
197 aa  60.1  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0362901  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5085  HupE/UreJ protein  37.12 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.893105  normal  0.0304442 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3799  HupE/UreJ protein  34.1 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414571  normal  0.346057 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0960  HupE/UreJ protein  30.59 
 
 
194 aa  59.7  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4125  urease accessory protein UreJ  32.56 
 
 
192 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.4167 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0164  nickel-iron hydrogenase, accessory protein  29.25 
 
 
192 aa  58.9  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1184  HupE/UreJ protein  35.14 
 
 
203 aa  58.5  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0993  HupE/UreJ protein  29.86 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.614894  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0663  HupE/UreJ protein  28.57 
 
 
190 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.32608  normal  0.0353183 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5001  HupE/UreJ protein  31.66 
 
 
192 aa  55.1  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.66529  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1210  HupE/UreJ protein  32.22 
 
 
186 aa  54.7  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0327  HupE/UreJ protein  29.83 
 
 
191 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.994931  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0479  hydrogenase/urease accessory protein  37.12 
 
 
166 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230165  normal  0.16849 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2281  HupE/UreJ protein  37.5 
 
 
203 aa  54.3  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5823  HupE/UreJ protein  33.85 
 
 
192 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2989  HupE/UreJ protein  33.33 
 
 
191 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.231706  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1166  HupE/UreJ protein  30.67 
 
 
194 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.232797  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3747  HupE/UreJ protein  32.58 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5110  HupE/UreJ protein  34.48 
 
 
199 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.774333  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3245  urease accessory protein UreJ  33.08 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3272  urease accessory protein UreJ  28.57 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2188  HupE/UreJ protein  31.38 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.382919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1158  HupE/UreJ protein  34.35 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160824  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0830  urease accessory protein  29.45 
 
 
202 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0959  HupE/UreJ protein  26.73 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.355166  normal  0.073414 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1763  HupE/UreJ protein  27.04 
 
 
188 aa  50.8  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.353058  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1164  HupE/UreJ protein  30 
 
 
194 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2034  urease accessory UREJ transmembrane protein  31.95 
 
 
205 aa  49.7  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159278  normal  0.357302 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0886  HupE/UreJ protein  31.93 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.219262  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4241  HupE/UreJ protein  34.17 
 
 
199 aa  49.3  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2123  HupE/UreJ protein  30.81 
 
 
203 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.150292  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2438  HupE/UreJ protein  35.97 
 
 
195 aa  48.9  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0333  HupE/UreJ protein  32.32 
 
 
195 aa  48.5  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.836087  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2876  HupE/UreJ protein  31.73 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2825  HupE/UreJ protein  33.54 
 
 
196 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.324254  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2301  HupE/UreJ protein  29.44 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3099  HupE/UreJ protein  26.63 
 
 
194 aa  45.4  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2290  HupE/UreJ protein  30.07 
 
 
192 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202641  normal  0.223499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0560  HupE/UreJ protein  29.21 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.180214  normal  0.949799 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3268  urease accessory protein  32.74 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.232463  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1863  HupE/UreJ protein  30.56 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.867351  normal  0.454948 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50400  HupE/UreJ protein  32.77 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2148  HupE/UreJ protein  27.84 
 
 
191 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.140678  normal  0.213077 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4912  urease accessory protein, putative  27.78 
 
 
190 aa  42.7  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2186  HupE/UreJ protein  27.75 
 
 
205 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114509 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0497  HupE/UreJ accessory protein  27.84 
 
 
191 aa  42.4  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>