22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_12311 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009091  P9301_12311  putative hydrogenase accessory protein  100 
 
 
234 aa  446  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03731  hypothetical protein  61.33 
 
 
209 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1592  putative hydrogenase accessory protein  56.91 
 
 
210 aa  202  5e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.150539  hitchhiker  0.00246904 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2011  putative hydrogenase accessory protein  59.78 
 
 
210 aa  198  7e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14481  hypothetical protein  55.1 
 
 
204 aa  193  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0621  hydrogenase accessory membrane protein  58.47 
 
 
210 aa  185  4e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21111  putative hydrogenase accessory protein  56.83 
 
 
187 aa  180  1e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.543051 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2095  HupE/UreJ protein  31.41 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2139  HupE/UreJ protein  31.12 
 
 
221 aa  80.1  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1373  hydrogenase accessory protein  31.65 
 
 
231 aa  77  0.0000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.695906  normal  0.247708 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3141  hypothetical protein  37.41 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0344917  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1026  HupE/UreJ protein  31.98 
 
 
226 aa  70.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4228  HupE/UreJ protein  34.03 
 
 
217 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5052  HupE/UreJ protein  29.51 
 
 
211 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.864731  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3099  HupE/UreJ protein  36.96 
 
 
194 aa  47  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3799  HupE/UreJ protein  34.69 
 
 
198 aa  43.5  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.414571  normal  0.346057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0327  HupE/UreJ protein  34.04 
 
 
191 aa  42.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.994931  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3991  HupE/UreJ protein  33.71 
 
 
192 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3969  HupE/UreJ protein  33.71 
 
 
192 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4085  HupE/UreJ protein  33.71 
 
 
192 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00450512 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3892  HupE/UreJ protein  33.71 
 
 
192 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430028 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4125  urease accessory protein UreJ  29.01 
 
 
192 aa  42.4  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.4167 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>