29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2398 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  100 
 
 
196 aa  384  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  90.82 
 
 
196 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  89.8 
 
 
196 aa  351  5e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  88.66 
 
 
200 aa  342  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  82.74 
 
 
197 aa  319  9.999999999999999e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  80.71 
 
 
197 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  50.25 
 
 
202 aa  175  4e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  48.19 
 
 
192 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  47.34 
 
 
206 aa  164  9e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  47.12 
 
 
189 aa  155  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  40 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  41.88 
 
 
186 aa  121  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  37.89 
 
 
186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  42.21 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  43.37 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  37.07 
 
 
201 aa  100  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  36.76 
 
 
170 aa  98.2  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1374  flagellin  36.65 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  35.57 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  30.43 
 
 
179 aa  66.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  44.58 
 
 
91 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0234  hypothetical protein  24.23 
 
 
207 aa  50.1  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.655501 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  32.63 
 
 
302 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  42.59 
 
 
310 aa  49.3  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0104  flagellin  30.17 
 
 
259 aa  46.2  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.514417  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1004  flagellin  26.79 
 
 
209 aa  43.9  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.790053  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3418  flagellin  31.67 
 
 
201 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1739  flagellin  24.41 
 
 
212 aa  42.4  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0243  flagellin  26.8 
 
 
216 aa  42.4  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.374886  normal  0.319866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>