24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1374 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1374  flagellin  100 
 
 
193 aa  384  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  38.89 
 
 
197 aa  129  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  37.06 
 
 
196 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  39.18 
 
 
192 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  38.89 
 
 
197 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  35.53 
 
 
200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  36.65 
 
 
196 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  36.65 
 
 
196 aa  111  7.000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  37.97 
 
 
189 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  34.9 
 
 
186 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  35.29 
 
 
202 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  31.91 
 
 
186 aa  101  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  32.42 
 
 
186 aa  94.7  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  34.17 
 
 
206 aa  94.4  9e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  33.85 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  37.23 
 
 
186 aa  82  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  32.93 
 
 
170 aa  77.8  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  37.63 
 
 
190 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  31.94 
 
 
186 aa  55.8  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  38.6 
 
 
310 aa  54.7  0.0000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  35.09 
 
 
302 aa  50.1  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  40.98 
 
 
91 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  52.38 
 
 
179 aa  48.5  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0234  hypothetical protein  24.88 
 
 
207 aa  42  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.655501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>