22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3139 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  100 
 
 		 179 aa  368  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  40.33 
 
 		 170 aa  121  6e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  34.29 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  33.14 
 
 		 192 aa  86.3  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  30.73 
 
 		 202 aa  86.3  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  30.77 
 
 		 196 aa  84.7  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  28.42 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  32.6 
 
 		 201 aa  82  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  28.33 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  30.77 
 
 		 196 aa  81.3  0.000000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  30.48 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  29.67 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  30.94 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  29.21 
 
 		 186 aa  70.9  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  29.12 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  42.35 
 
 		 91 aa  65.1  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  50 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  31.46 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  33.53 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  32.05 
 
 		 310 aa  53.9  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  35.85 
 
 		 302 aa  47.8  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1374  flagellin  52.38 
 
 		 193 aa  45.1  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>