24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0884 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  100 
 
 
186 aa  373  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  75.14 
 
 
186 aa  289  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  72.97 
 
 
186 aa  271  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  43.92 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  42.78 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  42.47 
 
 
196 aa  124  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  41.4 
 
 
196 aa  122  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  41.88 
 
 
196 aa  121  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  38.34 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  40.86 
 
 
200 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  37.95 
 
 
206 aa  112  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  38.2 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  40.11 
 
 
189 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  37.99 
 
 
170 aa  90.5  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1374  flagellin  34.78 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  37.36 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  37.44 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  33.33 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  48 
 
 
91 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  57.63 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  29.12 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  32.79 
 
 
310 aa  48.5  0.00005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0500  hypothetical protein  25.71 
 
 
177 aa  47  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  27.83 
 
 
302 aa  46.2  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>