25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2393 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  100 
 
 
186 aa  373  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  76.34 
 
 
186 aa  295  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  75.14 
 
 
186 aa  289  2e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  40.62 
 
 
197 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  40.1 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  40 
 
 
196 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  40 
 
 
196 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  40.93 
 
 
196 aa  125  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  40.41 
 
 
200 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  38.19 
 
 
202 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  34.24 
 
 
192 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  37.31 
 
 
206 aa  105  4e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  37.93 
 
 
189 aa  97.8  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  36.36 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  36.56 
 
 
186 aa  84.3  8e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1374  flagellin  31.91 
 
 
193 aa  80.5  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  37.22 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  50.85 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  32.18 
 
 
186 aa  64.3  0.0000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  43.24 
 
 
91 aa  62.8  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  32.79 
 
 
310 aa  48.9  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  50 
 
 
179 aa  48.9  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  30.43 
 
 
302 aa  48.1  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0500  hypothetical protein  26.09 
 
 
177 aa  47.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1289  hypothetical protein  28.41 
 
 
186 aa  42  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00303035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>