25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2395 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  100 
 
 
196 aa  387  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  89.8 
 
 
196 aa  351  5e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  89.29 
 
 
196 aa  350  8e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  90.05 
 
 
200 aa  339  1e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  84.26 
 
 
197 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  84.9 
 
 
197 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  49.26 
 
 
202 aa  173  9.999999999999999e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  47.83 
 
 
206 aa  169  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  46.23 
 
 
192 aa  164  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  44.5 
 
 
189 aa  142  3e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  40 
 
 
186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  42.47 
 
 
186 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  40.62 
 
 
186 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  43 
 
 
186 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  41.71 
 
 
190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  37.84 
 
 
170 aa  100  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  37.38 
 
 
201 aa  99.8  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1374  flagellin  36.65 
 
 
193 aa  86.3  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  36.13 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  55.36 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  29.35 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  42.59 
 
 
310 aa  49.7  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  28.12 
 
 
302 aa  48.1  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0234  hypothetical protein  23.71 
 
 
207 aa  47.8  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.655501 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1739  flagellin  26.51 
 
 
212 aa  43.1  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>