40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1739 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1739  flagellin  100 
 
 
212 aa  419  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1004  flagellin  74.41 
 
 
209 aa  318  3e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.790053  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0941  flagellin  74.88 
 
 
209 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.561484  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0968  flagellin  61.61 
 
 
206 aa  229  3e-59  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0258  flagellin protein  48.34 
 
 
214 aa  157  1e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00883872  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0259  flagellin protein  48.82 
 
 
214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.010095  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0260  flagellin protein  48.34 
 
 
214 aa  153  2e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0967  flagellin protein  43.56 
 
 
222 aa  150  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0256  flagellin protein  47.66 
 
 
219 aa  148  6e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284385  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0939  flagellin protein  45.74 
 
 
229 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1740  flagellin  42.66 
 
 
216 aa  142  3e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1006  flagellin  45.54 
 
 
221 aa  141  9e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0966  flagellin protein  46.15 
 
 
215 aa  139  3e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1741  flagellin  45.21 
 
 
215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0940  flagellin protein  43.24 
 
 
219 aa  134  9e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.545425  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1005  flagellin  44.5 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1742  flagellin  54.14 
 
 
322 aa  101  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1007  flagellin  53.33 
 
 
326 aa  95.5  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0938  flagellin protein  53.51 
 
 
402 aa  90.1  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0257  flagellin protein  57.94 
 
 
436 aa  87.8  1e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3419  flagellin  44.14 
 
 
205 aa  80.9  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2862  flagellin  30.45 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.747141  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0243  flagellin  37.89 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.374886  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3418  flagellin  47.06 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2557  flagellin  43.97 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0104  flagellin  36.79 
 
 
259 aa  78.6  0.00000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.514417  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2864  flagellin  52 
 
 
395 aa  78.6  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2863  flagellin  38.31 
 
 
259 aa  78.2  0.00000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1322  flagellin  28.7 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2865  flagellin  43.24 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.515707  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0241  flagellin  38.96 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578981  normal  0.41727 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0242  flagellin  59.38 
 
 
228 aa  76.3  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.592647  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0949  flagellin  33.53 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0144  flagellin  28.51 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0948  flagellin  57.38 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.528347  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2495  flagellin  44.34 
 
 
223 aa  65.1  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0641  flagellin  51.43 
 
 
291 aa  58.5  0.00000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0051  flagellin  38.57 
 
 
546 aa  45.1  0.0008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  26.51 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  24.41 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>