40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1004 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1004  flagellin  100 
 
 
209 aa  416  1e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.790053  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0941  flagellin  92.34 
 
 
209 aa  364  1e-100  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.561484  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1739  flagellin  74.41 
 
 
212 aa  318  3e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0968  flagellin  65.07 
 
 
206 aa  242  3e-63  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0258  flagellin protein  46.98 
 
 
214 aa  154  7e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00883872  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0259  flagellin protein  46.51 
 
 
214 aa  150  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.010095  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0939  flagellin protein  44.98 
 
 
229 aa  149  3e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1006  flagellin  46.82 
 
 
221 aa  148  6e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0260  flagellin protein  46.05 
 
 
214 aa  148  7e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0940  flagellin protein  45.21 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.545425  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0967  flagellin protein  43.81 
 
 
222 aa  146  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0966  flagellin protein  47.3 
 
 
215 aa  143  2e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0256  flagellin protein  46.26 
 
 
219 aa  141  6e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284385  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1005  flagellin  43.95 
 
 
221 aa  141  6e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1740  flagellin  42.66 
 
 
216 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1741  flagellin  45.16 
 
 
215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1742  flagellin  58.82 
 
 
322 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1007  flagellin  54.48 
 
 
326 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0938  flagellin protein  60.71 
 
 
402 aa  99  5e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0241  flagellin  39.62 
 
 
233 aa  88.6  6e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578981  normal  0.41727 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0257  flagellin protein  51.91 
 
 
436 aa  87.8  9e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3418  flagellin  43.4 
 
 
201 aa  86.3  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3419  flagellin  41.35 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0242  flagellin  38.12 
 
 
228 aa  79.3  0.00000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.592647  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1322  flagellin  29.07 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2862  flagellin  48.35 
 
 
201 aa  78.2  0.00000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.747141  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2557  flagellin  44.35 
 
 
243 aa  75.9  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0243  flagellin  41.82 
 
 
216 aa  75.5  0.0000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.374886  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2865  flagellin  41.48 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.515707  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2863  flagellin  44.25 
 
 
259 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2864  flagellin  59.02 
 
 
395 aa  74.3  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0104  flagellin  34.22 
 
 
259 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.514417  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0948  flagellin  41.32 
 
 
208 aa  71.6  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.528347  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0144  flagellin  30.91 
 
 
216 aa  70.5  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0949  flagellin  54.1 
 
 
202 aa  66.2  0.0000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2495  flagellin  48.94 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0641  flagellin  52.24 
 
 
291 aa  55.8  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0051  flagellin  40 
 
 
546 aa  45.4  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  26.79 
 
 
196 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  22.17 
 
 
196 aa  42.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>