37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2557 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012029  Hlac_2557  flagellin  100 
 
 
243 aa  476  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2865  flagellin  52.85 
 
 
261 aa  225  6e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.515707  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2863  flagellin  52.31 
 
 
259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2862  flagellin  38.11 
 
 
201 aa  117  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.747141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3418  flagellin  52.14 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0243  flagellin  50.71 
 
 
216 aa  109  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.374886  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3419  flagellin  50.41 
 
 
205 aa  108  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0241  flagellin  52.46 
 
 
233 aa  106  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578981  normal  0.41727 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0242  flagellin  56.2 
 
 
228 aa  104  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.592647  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0949  flagellin  53.04 
 
 
202 aa  103  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2864  flagellin  65.85 
 
 
395 aa  98.2  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0948  flagellin  48.12 
 
 
208 aa  94.7  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.528347  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2495  flagellin  56.07 
 
 
223 aa  93.2  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1739  flagellin  43.97 
 
 
212 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1004  flagellin  44.35 
 
 
209 aa  75.9  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.790053  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0941  flagellin  43.86 
 
 
209 aa  75.1  0.0000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.561484  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0967  flagellin protein  39.2 
 
 
222 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1742  flagellin  41.55 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1007  flagellin  51.96 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0939  flagellin protein  46.22 
 
 
229 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1741  flagellin  51.02 
 
 
215 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0938  flagellin protein  53.92 
 
 
402 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0256  flagellin protein  50.53 
 
 
219 aa  68.2  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284385  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0940  flagellin protein  51.58 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.545425  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0966  flagellin protein  38.89 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1005  flagellin  51.58 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1006  flagellin  51.58 
 
 
221 aa  65.5  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0260  flagellin protein  33.14 
 
 
214 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0259  flagellin protein  31.95 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.010095  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0258  flagellin protein  47.31 
 
 
214 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00883872  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1740  flagellin  46.32 
 
 
216 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0257  flagellin protein  44.33 
 
 
436 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131953  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1322  flagellin  33.04 
 
 
212 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0104  flagellin  37.59 
 
 
259 aa  56.2  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.514417  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0968  flagellin  42.47 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0144  flagellin  42.31 
 
 
216 aa  52.8  0.000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0641  flagellin  50.77 
 
 
291 aa  42.4  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>