37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0242 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0242  flagellin  100 
 
 
228 aa  444  1.0000000000000001e-124  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.592647  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0241  flagellin  76.82 
 
 
233 aa  327  7e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578981  normal  0.41727 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0243  flagellin  75.22 
 
 
216 aa  299  3e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.374886  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2495  flagellin  59.83 
 
 
223 aa  216  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0948  flagellin  50 
 
 
208 aa  193  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.528347  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0949  flagellin  50.44 
 
 
202 aa  194  1e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2862  flagellin  41.36 
 
 
201 aa  126  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.747141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3418  flagellin  37.66 
 
 
201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3419  flagellin  36.17 
 
 
205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2557  flagellin  56.2 
 
 
243 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2863  flagellin  53.33 
 
 
259 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2865  flagellin  53.85 
 
 
261 aa  101  8e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.515707  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2864  flagellin  65.33 
 
 
395 aa  91.3  1e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1631  hypothetical protein  34.41 
 
 
295 aa  89  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1004  flagellin  38.12 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.790053  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1739  flagellin  59.38 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1741  flagellin  36.31 
 
 
215 aa  74.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0941  flagellin  53.33 
 
 
209 aa  74.7  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.561484  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1740  flagellin  42.2 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0966  flagellin protein  42.98 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1006  flagellin  40.87 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0940  flagellin protein  43 
 
 
219 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.545425  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1005  flagellin  32.58 
 
 
221 aa  58.9  0.00000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0256  flagellin protein  52.11 
 
 
219 aa  58.5  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284385  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0939  flagellin protein  61.29 
 
 
229 aa  58.5  0.00000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0258  flagellin protein  34.85 
 
 
214 aa  57.8  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00883872  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0260  flagellin protein  38.26 
 
 
214 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0259  flagellin protein  38.26 
 
 
214 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.010095  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0967  flagellin protein  47.37 
 
 
222 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1742  flagellin  31.25 
 
 
322 aa  55.1  0.0000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0257  flagellin protein  36.21 
 
 
436 aa  54.3  0.000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131953  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1322  flagellin  32.41 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0938  flagellin protein  63.16 
 
 
402 aa  53.1  0.000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1007  flagellin  55.56 
 
 
326 aa  51.6  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0104  flagellin  58.93 
 
 
259 aa  51.2  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.514417  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0968  flagellin  35.09 
 
 
206 aa  47.4  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0144  flagellin  33.33 
 
 
216 aa  43.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>