40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_1742 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1742  flagellin  100 
 
 
322 aa  644    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0257  flagellin protein  40.3 
 
 
436 aa  143  4e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.131953  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1741  flagellin  61.9 
 
 
215 aa  125  7e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1004  flagellin  58.82 
 
 
209 aa  125  8.000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.790053  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1739  flagellin  54.14 
 
 
212 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0941  flagellin  69.79 
 
 
209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.561484  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0939  flagellin protein  55.4 
 
 
229 aa  117  3e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1740  flagellin  60.33 
 
 
216 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0938  flagellin protein  66.96 
 
 
402 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0966  flagellin protein  55.81 
 
 
215 aa  114  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0967  flagellin protein  65.71 
 
 
222 aa  110  3e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1007  flagellin  61.61 
 
 
326 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0259  flagellin protein  57.26 
 
 
214 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.010095  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0260  flagellin protein  57.85 
 
 
214 aa  107  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0258  flagellin protein  56.45 
 
 
214 aa  106  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00883872  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1006  flagellin  53.38 
 
 
221 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0940  flagellin protein  55.93 
 
 
219 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.545425  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0256  flagellin protein  58.93 
 
 
219 aa  103  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284385  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1005  flagellin  60.38 
 
 
221 aa  99.4  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0968  flagellin  48.72 
 
 
206 aa  92.8  6e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2557  flagellin  41.55 
 
 
243 aa  89.7  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3418  flagellin  40.29 
 
 
201 aa  89.4  8e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2862  flagellin  42.2 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.747141  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3419  flagellin  41.03 
 
 
205 aa  82.8  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2865  flagellin  46.15 
 
 
261 aa  82  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.515707  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2863  flagellin  45.19 
 
 
259 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.770292  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2864  flagellin  60.32 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.741123  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0241  flagellin  39.29 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.578981  normal  0.41727 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0242  flagellin  31.25 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.592647  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0243  flagellin  37.96 
 
 
216 aa  73.6  0.000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.374886  normal  0.319866 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0948  flagellin  37.98 
 
 
208 aa  70.1  0.00000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.528347  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2495  flagellin  44.21 
 
 
223 aa  69.3  0.00000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1322  flagellin  34.51 
 
 
212 aa  65.9  0.0000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0949  flagellin  40.21 
 
 
202 aa  65.5  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0104  flagellin  38.66 
 
 
259 aa  63.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.514417  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0144  flagellin  42.37 
 
 
216 aa  60.5  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0641  flagellin  50.75 
 
 
291 aa  49.3  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  26.09 
 
 
196 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  26.09 
 
 
196 aa  46.6  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  25 
 
 
197 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>