28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2392 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  100 
 
 
196 aa  386  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  90.82 
 
 
196 aa  355  1.9999999999999998e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  89.8 
 
 
200 aa  352  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  89.29 
 
 
196 aa  350  8e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  84.77 
 
 
197 aa  330  7.000000000000001e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  83.25 
 
 
197 aa  317  7e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  51.96 
 
 
202 aa  181  5.0000000000000004e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  50 
 
 
206 aa  169  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  48.19 
 
 
192 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  47.12 
 
 
189 aa  153  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  40.93 
 
 
186 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  41.4 
 
 
186 aa  122  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  37.89 
 
 
186 aa  117  9e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  42.21 
 
 
186 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  42.78 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  39.91 
 
 
201 aa  107  9.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  36.96 
 
 
170 aa  95.9  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1374  flagellin  37.06 
 
 
193 aa  93.6  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  37.84 
 
 
186 aa  67.4  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  55.56 
 
 
91 aa  64.7  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  29.67 
 
 
179 aa  62.8  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  38.46 
 
 
310 aa  52  0.000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1322  flagellin  25.19 
 
 
212 aa  50.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  30.93 
 
 
302 aa  48.1  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0104  flagellin  29.91 
 
 
259 aa  45.1  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.514417  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3418  flagellin  30 
 
 
201 aa  43.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0234  hypothetical protein  23.28 
 
 
207 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.655501 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1004  flagellin  22.17 
 
 
209 aa  42.4  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.790053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>