8 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0234 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0234  hypothetical protein  100 
 
 
207 aa  421  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.655501 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0500  hypothetical protein  31.95 
 
 
177 aa  89.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  24.23 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  23.71 
 
 
196 aa  47.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  25.93 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  22.97 
 
 
192 aa  46.2  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  23.28 
 
 
196 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  29.07 
 
 
200 aa  41.2  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>