24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0962 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0962  flagellin  100 
 
 
192 aa  388  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  47.72 
 
 
202 aa  170  1e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  48.19 
 
 
196 aa  167  1e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  50 
 
 
197 aa  165  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  46.23 
 
 
196 aa  164  5e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  48.19 
 
 
196 aa  164  9e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  49.22 
 
 
197 aa  160  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  45.54 
 
 
206 aa  160  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  46.63 
 
 
200 aa  157  7e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  48.47 
 
 
189 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  45.36 
 
 
186 aa  123  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  43.62 
 
 
190 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  35.12 
 
 
201 aa  108  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  35.91 
 
 
186 aa  108  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  38.2 
 
 
186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  34.24 
 
 
186 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  37.43 
 
 
170 aa  98.6  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1374  flagellin  39.18 
 
 
193 aa  92.8  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  36.02 
 
 
186 aa  69.7  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  33.14 
 
 
179 aa  68.2  0.00000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  52.63 
 
 
91 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  35.82 
 
 
310 aa  52  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  32.14 
 
 
302 aa  48.5  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0234  hypothetical protein  22.97 
 
 
207 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.655501 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>