23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1970 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  100 
 
 
201 aa  400  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  43.15 
 
 
186 aa  118  6e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  35.81 
 
 
202 aa  111  6e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  35.12 
 
 
192 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  35.41 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  39.91 
 
 
196 aa  107  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  37.11 
 
 
189 aa  103  1e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  37.07 
 
 
196 aa  100  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  37.38 
 
 
196 aa  99.8  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  42.16 
 
 
190 aa  99.4  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  35.65 
 
 
197 aa  99  4e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  35.1 
 
 
197 aa  99  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  36.49 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  32.4 
 
 
170 aa  72  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  57.63 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  50.85 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  28.64 
 
 
186 aa  63.9  0.000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  32.6 
 
 
179 aa  62.4  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1374  flagellin  33.17 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  53.97 
 
 
186 aa  47.8  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  42.59 
 
 
91 aa  47.8  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  33.33 
 
 
310 aa  47.8  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  23.53 
 
 
302 aa  42.4  0.004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>