21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1238 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  100 
 
 
91 aa  184  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  60.47 
 
 
170 aa  103  7e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  48 
 
 
186 aa  70.1  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  43.75 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  43.75 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  55.56 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  55.36 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  44.58 
 
 
196 aa  63.9  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  52.63 
 
 
192 aa  63.9  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  54.72 
 
 
189 aa  62.4  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  43.24 
 
 
186 aa  62.8  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  50 
 
 
202 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  46.67 
 
 
206 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  50.94 
 
 
200 aa  56.2  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  36.9 
 
 
186 aa  52.4  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  42.59 
 
 
201 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  42.35 
 
 
179 aa  47.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  48.78 
 
 
190 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  38.33 
 
 
310 aa  45.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  37.5 
 
 
302 aa  43.9  0.0008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  40.26 
 
 
186 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>