18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1330 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  100 
 
 		 302 aa  600  1e-170  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  69.03 
 
 		 310 aa  372  1e-102  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  38.33 
 
 		 202 aa  52.8  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  37.88 
 
 		 189 aa  50.8  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  37.31 
 
 		 206 aa  50.8  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  32.63 
 
 		 196 aa  50.1  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  29.47 
 
 		 197 aa  48.9  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  32.14 
 
 		 192 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  30.93 
 
 		 196 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  30.43 
 
 		 186 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  28.12 
 
 		 196 aa  48.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  30.21 
 
 		 197 aa  47.8  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  27.83 
 
 		 186 aa  46.2  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  37.04 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  32.56 
 
 		 200 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  26.88 
 
 		 170 aa  43.9  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  37.5 
 
 		 91 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  23.53 
 
 		 201 aa  42.4  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>