21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_0133 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_0133  flagellin  100 
 
 
310 aa  608  1e-173  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  69.03 
 
 
302 aa  407  1.0000000000000001e-112  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  29.84 
 
 
189 aa  60.8  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  29.76 
 
 
202 aa  60.5  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  40.3 
 
 
206 aa  57.4  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  30.43 
 
 
197 aa  56.2  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  28.83 
 
 
197 aa  55.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  32.69 
 
 
196 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  31.73 
 
 
196 aa  53.5  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  32.65 
 
 
196 aa  53.5  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  36.23 
 
 
192 aa  52.4  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  35.63 
 
 
200 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  31 
 
 
186 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  38.33 
 
 
170 aa  49.7  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  30.3 
 
 
186 aa  48.9  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  33.33 
 
 
201 aa  47.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0260  flagellin protein  31.94 
 
 
214 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0224049  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0259  flagellin protein  31.94 
 
 
214 aa  47.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.010095  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  29.52 
 
 
186 aa  47.4  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0258  flagellin protein  31.25 
 
 
214 aa  45.4  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00883872  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  38.33 
 
 
91 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>