26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2399 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  100 
 
 
200 aa  391  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  89.8 
 
 
196 aa  352  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  88.66 
 
 
196 aa  342  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  90.05 
 
 
196 aa  339  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  78.68 
 
 
197 aa  305  3e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  79.69 
 
 
197 aa  294  7e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  47.78 
 
 
202 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  48.5 
 
 
206 aa  161  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  46.63 
 
 
192 aa  157  7e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  43.46 
 
 
189 aa  142  5e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  40.41 
 
 
186 aa  123  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  40.86 
 
 
186 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  40.41 
 
 
186 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  37.37 
 
 
186 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  41.24 
 
 
190 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  36.49 
 
 
201 aa  96.3  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1374  flagellin  35.53 
 
 
193 aa  94.4  1e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  34.95 
 
 
170 aa  89.7  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  36.76 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  29.51 
 
 
179 aa  63.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  50.94 
 
 
91 aa  56.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  42.59 
 
 
310 aa  48.1  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0104  flagellin  29.82 
 
 
259 aa  45.8  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.514417  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  32.56 
 
 
302 aa  44.7  0.0009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0234  hypothetical protein  29.07 
 
 
207 aa  41.2  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.655501 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1322  flagellin  25.38 
 
 
212 aa  41.2  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>