22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1375 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  100 
 
 
186 aa  374  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  38.5 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  36.32 
 
 
197 aa  91.7  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  45.69 
 
 
197 aa  90.9  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  35.48 
 
 
192 aa  88.2  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  33.33 
 
 
186 aa  87.4  1e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  36.13 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  37.84 
 
 
196 aa  86.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  35.57 
 
 
196 aa  85.9  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  36.76 
 
 
200 aa  85.1  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  31.44 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  32 
 
 
186 aa  82.4  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  36.63 
 
 
186 aa  81.3  0.000000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  31.31 
 
 
202 aa  79  0.00000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  32.18 
 
 
186 aa  78.2  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  53.97 
 
 
201 aa  67.8  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  31.58 
 
 
190 aa  64.3  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  57.41 
 
 
170 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  40.26 
 
 
91 aa  57  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1374  flagellin  31.94 
 
 
193 aa  48.9  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  34.92 
 
 
302 aa  45.8  0.0003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  34.92 
 
 
310 aa  45.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>