24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2397 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  100 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  76.34 
 
 		 186 aa  295  2e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  72.97 
 
 		 186 aa  271  3e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  38.42 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  37.89 
 
 		 197 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  37.89 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  40.62 
 
 		 196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  37.89 
 
 		 196 aa  117  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  37.37 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  35.35 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  35.91 
 
 		 192 aa  108  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  34 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  34.97 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  33.52 
 
 		 170 aa  87  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  34.34 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1374  flagellin  32.42 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  33.68 
 
 		 190 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  32.37 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  28.64 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  29.21 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  36.9 
 
 		 91 aa  52.4  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0364051 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  33.9 
 
 		 310 aa  46.6  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  37.04 
 
 		 302 aa  45.1  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0500  hypothetical protein  25.7 
 
 		 177 aa  44.7  0.0008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>