26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2391 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2391  flagellin  100 
 
 
197 aa  392  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2396  flagellin  96.95 
 
 
197 aa  380  1e-105  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.297369  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2392  flagellin  83.25 
 
 
196 aa  325  3e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2395  flagellin  84.9 
 
 
196 aa  320  8e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.474236  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2398  flagellin  80.71 
 
 
196 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.572844  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2399  flagellin  79.69 
 
 
200 aa  302  2.0000000000000002e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.499101  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1348  flagellin  50.74 
 
 
202 aa  179  2e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.182161  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1347  flagellin  49.76 
 
 
206 aa  167  9e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.320547  normal  0.210099 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0962  flagellin  49.74 
 
 
192 aa  165  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.366379  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0963  flagellin  46.56 
 
 
189 aa  149  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.252752  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0884  flagellin  42.78 
 
 
186 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2393  flagellin  40.1 
 
 
186 aa  136  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2397  flagellin  37.89 
 
 
186 aa  132  3e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.210845  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0346  flagellin  38.34 
 
 
190 aa  106  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.32901  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3140  flagellin  38.59 
 
 
170 aa  106  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000925657  normal  0.0146559 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0347  flagellin  39.58 
 
 
186 aa  105  5e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1374  flagellin  39.39 
 
 
193 aa  104  9e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1970  flagellin  35.58 
 
 
201 aa  99  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1375  flagellin-like protein  37.5 
 
 
186 aa  72.4  0.000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1238  flagellin (flaB1-1)  43.75 
 
 
91 aa  68.2  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0364051 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3139  flagellin  28.57 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00225153  normal  0.0136531 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0133  flagellin  37.1 
 
 
310 aa  50.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1322  flagellin  24.44 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1330  flagellin-like protein  30.85 
 
 
302 aa  49.3  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416332  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0234  hypothetical protein  25 
 
 
207 aa  44.7  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.655501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2862  flagellin  34.41 
 
 
201 aa  41.2  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.747141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>