107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0350 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_0350  Methyltransferase type 11  100 
 
 
254 aa  520  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0118067  normal  0.408422 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0306  methyltransferase type 11  33.05 
 
 
165 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
204 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
204 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  29.6 
 
 
204 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3413  putative methyltransferase  34.29 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.673339  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2181  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0100856 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 
204 aa  53.1  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3543  transcriptional regulator, ArsR family  32.67 
 
 
335 aa  52.4  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.304877 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0168  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.43 
 
 
207 aa  51.2  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1988  methyltransferase  29.09 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4002  Methyltransferase type 11  27.97 
 
 
238 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.708878  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0164  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.43 
 
 
207 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1067  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1030  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
216 aa  50.4  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.740234 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5049  methyltransferase type 11  24.39 
 
 
273 aa  48.9  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.300212  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  30 
 
 
204 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1747  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.19 
 
 
244 aa  48.9  0.00008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0822  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
224 aa  48.5  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.392895  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  30 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0251  methyltransferase type 11  31 
 
 
165 aa  48.1  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.999818 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0743  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
266 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.999893  normal  0.843892 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
309 aa  47.4  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  25.76 
 
 
278 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1067  transcriptional regulator, ArsR family  27.03 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.420275 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3999  Methyltransferase type 11  24.63 
 
 
274 aa  47.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3760  Methyltransferase type 11  35.87 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0167  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
281 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3809  Methyltransferase type 11  35.87 
 
 
279 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6455  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.65 
 
 
244 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  30 
 
 
204 aa  47  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1068  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.57 
 
 
251 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
246 aa  47  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1409  methyltransferase type 11  30.84 
 
 
243 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1327  methyltransferase  29.03 
 
 
258 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0582471  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
209 aa  46.2  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  33.7 
 
 
457 aa  45.8  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1903  methyltransferase type 11  28.22 
 
 
282 aa  45.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000234501  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1227  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.62 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.177857  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4089  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.87 
 
 
277 aa  45.8  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1074  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.62 
 
 
251 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32640  predicted protein  23.73 
 
 
771 aa  45.4  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.622568  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0726  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.62 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.195115  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2288  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.62 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508663  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2997  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.62 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1602  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.62 
 
 
251 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6211  phosphatidyl-N-methylethanolamine N-methyltransferase  32.67 
 
 
225 aa  45.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1111  methyltransferase type 11  23.48 
 
 
367 aa  45.1  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.0000134358  hitchhiker  0.0000106237 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1121  ArsR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2166  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 
237 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3468  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  25.44 
 
 
420 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2229  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
276 aa  44.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2287  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
282 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.108281  normal  0.170198 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1941  methyltransferase type 11  30.3 
 
 
194 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1467  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.53 
 
 
243 aa  44.3  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  28.69 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.63 
 
 
253 aa  43.9  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2906  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.63 
 
 
261 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3293  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4655  Methyltransferase type 11  35.96 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0904903  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5457  Methyltransferase type 11  31.31 
 
 
385 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26285  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0870  UbiE/COQ5 family methlytransferase  26.67 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.61862  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0826  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
224 aa  43.5  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.457177  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0214  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.3 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00594444  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2431  methyltransferase type 11  23.42 
 
 
250 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.508094 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04274  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
269 aa  43.5  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1066  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
238 aa  43.5  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1815  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2427  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
250 aa  43.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.992518  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1102  methyltransferase type 11  27.74 
 
 
249 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0215  UbiE/COQ5 family methlytransferase  28.3 
 
 
256 aa  43.5  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.383656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  26.38 
 
 
274 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  26.17 
 
 
239 aa  42.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5754  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.57 
 
 
250 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.767556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  26.92 
 
 
249 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6077  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 
277 aa  42.7  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.315329 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  27.68 
 
 
256 aa  42.7  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  34.34 
 
 
415 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.95 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0696  UbiE/COQ5 methyltransferase  34.44 
 
 
229 aa  42.7  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2940  protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase  28.7 
 
 
270 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1622  demethylmenaquinone methyltransferase  26.17 
 
 
251 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.95 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.25 
 
 
256 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.25 
 
 
256 aa  42.4  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0522  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
280 aa  42.7  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0758  Methyltransferase type 11  27.18 
 
 
189 aa  42.7  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00287175  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.49 
 
 
229 aa  42.4  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.416549  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1485  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
219 aa  42.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000041456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.95 
 
 
256 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.95 
 
 
256 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf183  predicted 23S rRNA methylase  31.62 
 
 
242 aa  42.4  0.007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.766257  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.25 
 
 
256 aa  42.4  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1953  Methyltransferase type 11  32.47 
 
 
191 aa  42.4  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.520694 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  26.49 
 
 
268 aa  42.4  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4216  methyltransferase type 11  25.85 
 
 
277 aa  42  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0224  UbiE/COQ5 family methlytransferase  27.36 
 
 
256 aa  42.4  0.008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.234424  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4035  ArsR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
312 aa  42.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1999  2-heptaprenyl-1,4- naphthoquinonemethyltransferas e  28.3 
 
 
235 aa  42.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.753273  normal  0.375757 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>