92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_2854 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_2854  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  100 
 
 
331 aa  638    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.320267  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2715  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  80.91 
 
 
330 aa  496  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3651  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  51.47 
 
 
335 aa  308  6.999999999999999e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.188386 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2887  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  50.15 
 
 
338 aa  294  1e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1512  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  47.35 
 
 
341 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0329401  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1408  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.82 
 
 
336 aa  285  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.548805 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2832  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  49.12 
 
 
338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.526344  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1124  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  48.82 
 
 
333 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1166  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.59 
 
 
335 aa  268  8.999999999999999e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413543  normal  0.128796 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1074  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  45.43 
 
 
335 aa  261  1e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0872589  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0853  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.71 
 
 
336 aa  246  6e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.127023  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1698  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  44.41 
 
 
326 aa  240  2e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187092 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0362  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  44.18 
 
 
330 aa  239  4e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0418  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  43.58 
 
 
330 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.174266  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0438  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  43.58 
 
 
330 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.221432  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0602  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase family protein  43.58 
 
 
330 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.122712  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1349  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  43.28 
 
 
330 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0095307  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3214  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  43.28 
 
 
330 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0245  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  43.28 
 
 
330 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0077  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  43.28 
 
 
330 aa  237  3e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.173973  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0196  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.81 
 
 
330 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601493  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.09 
 
 
330 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.375921  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2298  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.96 
 
 
330 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.41199  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0392  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.86 
 
 
330 aa  228  9e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997228  normal  0.019764 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2912  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.96 
 
 
330 aa  228  9e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0745729  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.39 
 
 
330 aa  227  2e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.444988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2961  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  42.39 
 
 
330 aa  226  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6255  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  41.79 
 
 
330 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.06 
 
 
327 aa  226  6e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.121204 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4235  putative fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.06 
 
 
327 aa  224  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.60461 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02179  2-oxopent-4-enoate hydratase  41.26 
 
 
345 aa  223  2e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003653  2-keto-4-pentenoate hydratase  40.11 
 
 
345 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1126  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.65 
 
 
340 aa  218  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1670  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  38.3 
 
 
328 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0962  hypothetical protein  41.06 
 
 
339 aa  216  4e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1439  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.47 
 
 
324 aa  216  5e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2219  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  38.12 
 
 
328 aa  215  7e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2671  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.72 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000904205  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2778  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.83 
 
 
328 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.446981  decreased coverage  0.0000187699 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1389  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.3 
 
 
328 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.300379  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02827  2-keto-4-pentenoate hydratase  40.58 
 
 
302 aa  212  9e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.320666  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2604  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.54 
 
 
328 aa  211  1e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000203014  hitchhiker  0.000000504618 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0301  hypothetical protein  40.72 
 
 
330 aa  210  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0742  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.23 
 
 
336 aa  210  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2865  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.43 
 
 
328 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172279  hitchhiker  0.0000000000624401 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1487  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.43 
 
 
328 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.169749  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1518  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.43 
 
 
328 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.250671  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.43 
 
 
328 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0103136  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03148  fumarylacetoacetate hydrolase  40.18 
 
 
331 aa  207  2e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.223064  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0081  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.3 
 
 
346 aa  207  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2592  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.24 
 
 
328 aa  206  4e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000318978  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0481  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.59 
 
 
329 aa  206  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0111  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.3 
 
 
326 aa  206  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2233  hypothetical protein  38.48 
 
 
332 aa  205  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2205  hypothetical protein  38.48 
 
 
332 aa  205  8e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3763  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  36.07 
 
 
329 aa  205  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860542  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6555  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.12 
 
 
325 aa  202  5e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.121187  normal  0.192536 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1438  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.55 
 
 
328 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.879034 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0449  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.48 
 
 
327 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510402  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1718  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.26 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.985216  normal  0.0471383 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1331  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.26 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0166395  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1451  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.96 
 
 
328 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0776794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2927  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.26 
 
 
328 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0440  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.48 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355876  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0155  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.52 
 
 
330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.757644 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0162  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.22 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0991  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  40.18 
 
 
341 aa  196  4.0000000000000005e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4783  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.48 
 
 
356 aa  195  7e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.155683  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0302  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.51 
 
 
327 aa  194  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0446  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.6 
 
 
331 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.266475  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3633  hypothetical protein  38.69 
 
 
327 aa  191  2e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0364537  normal  0.266279 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3569  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.82 
 
 
325 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.443421  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3501  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.82 
 
 
325 aa  187  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3420  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.53 
 
 
325 aa  186  7e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.236452  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3205  fumarylacetoacetate hydrolase family protein  40.71 
 
 
330 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3482  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  39.04 
 
 
324 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.78966 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4824  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.02 
 
 
335 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3138  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.52 
 
 
327 aa  172  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2303  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  38.3 
 
 
334 aa  171  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.753159  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0613  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  35.88 
 
 
334 aa  169  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1939  putative fumarylacetoacetate hydrolase  38.49 
 
 
333 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.615073  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0854  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  33.93 
 
 
331 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.914602  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4629  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.21 
 
 
338 aa  162  8.000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0673  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.88 
 
 
314 aa  159  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3422  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  37.16 
 
 
314 aa  155  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.247714  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5493  2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway)  35.82 
 
 
325 aa  152  8e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0905  putative fumarylacetoacetate hydrolase  36.83 
 
 
331 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.230721  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2396  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  36.88 
 
 
331 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.482447  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3264  hypothetical protein  35.38 
 
 
328 aa  137  2e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.197643 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2238  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  31.16 
 
 
320 aa  57  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2235  fumarylacetoacetate (FAA) hydrolase  30.57 
 
 
336 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117437  hitchhiker  0.00077103 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10957  bifunctional 2-hydroxyhepta-2,4-diene-1,7-dioate isomerase/cyclase/dehydrase  27.02 
 
 
644 aa  42.7  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.761321 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>